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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001906`

染色体: Chr07 坐标: 16464338-16473614 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001906`
名称	SmilChr07G001906
描述	urease
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16464338 - 16473614 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995592`
GeneID	`130995592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995592`
原始查询	`SmilChr07G001906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	urease
产物	urease
Arabidopsis	`AT1G67550` (URE) urease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843076] identity=76.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0009039 (urease activity); GO:0016151 (nickel cation binding); GO:0035550 (urease complex); GO:0043419 (urea catabolic process)
KEGG	smil00220 (Arginine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00449 (Urease_alpha); PF00547 (Urease_gamma); PF00699 (Urease_beta); PF01979 (Amidohydro_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776932.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057776932.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776932.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776932.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16465912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:16466231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B86,C76
`Chr7:16468797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B131,B56
`Chr7:16469065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C23,C61,D6
`Chr7:16470183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776932.1

837 aa

418

837

Urease_gamma

Urease_beta

Urease_alpha

Amidohydro_1

PF00547 Urease_gamma 1-100 aa PF00699 Urease_beta 133-228 aa PF00449 Urease_alpha 271-389 aa PF01979 Amidohydro_1 395-723 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776932.1`	Pfam	`PF00547`	Urease_gamma	Domain	1	100	1.3e-42	144.9	Urease, gamma subunit
`XP_057776932.1`	Pfam	`PF00699`	Urease_beta	Domain	133	228	1.6e-41	141.0	Urease beta subunit
`XP_057776932.1`	Pfam	`PF00449`	Urease_alpha	Domain	271	389	6.4e-55	185.4	Urease alpha-subunit, N-terminal domain
`XP_057776932.1`	Pfam	`PF01979`	Amidohydro_1	Domain	395	723	1.4e-78	265.3	Amidohydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920949.1
CAAGTCGTCGATCTCATCTCAGAAAGTATATTCGAAAGTGGAATATAGTAGTAACCGATTTGTATATTTATAGTAGTAAGATTTAATATTGAAGAATGTGCCTTTTTGGAATCTATATGGAGCACTCAAACCCACCACTGCACTCTGATTCTGAGTTTGACTTGGGAAGAACAATAACCGATTCCCACAAAATTATTTTCCAATCAAATTTCGGCTCAACTTCAACAAAAGATGAAGCTGGCGCCGAGGGAAATTGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995592
ATGAAGCTGGCGCCGAGGGAAATTGAGAAATTGATGCTCCACAATGCTGGAGAGTTGGCTCAGAAGCGTTTGGCTCGTGGATTAAGGCTAAATCACGCCGAAGCCGTCGCTCTTATTGCAGCGCAGATATTGGAATTTGTCCGGGATGGGGATAAAAGCGTGGTCGAGTTAATGGATCTTGGAAGACAAATTTTGGGAAGGAGACAAGTTCTTCCATCTGTTCCTTATCTATTGCATGCTGTCCAGGTTGAGGGGACCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776932.1
MKLAPREIEKLMLHNAGELAQKRLARGLRLNHAEAVALIAAQILEFVRDGDKSVVELMDLGRQILGRRQVLPSVPYLLHAVQVEGTFPDGTKLITIHDPVSCENGNLDLALHGSFLPAPSLDKFPPVEICKVPGELICGPGHITINLGRKGVVLKVTNTGDRPVQVGSHYHFIEVNPHLVFDRRRAYGKRLNIPAGTAIRFEPGDTKSVSLVSIGGNQIIRGGNNIADAPVHDSRITSVMKAVHEERYGFSEEADAREFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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