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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001919`

染色体: Chr07 坐标: 16603842-16608056 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001919`
名称	SmilChr07G001919
描述	nuclear pore complex protein NUP54
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16603842 - 16608056 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995602`
GeneID	`130995602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995602`
原始查询	`SmilChr07G001919`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP54
产物	nuclear pore complex protein NUP54
Arabidopsis	`AT1G24310` (AT1G24310) nuclear pore complex protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839047] identity=64.6; qcov=0.992; evalue=1.33e-158; confidence=high
Rice	`Os07g0295400` (B1120F06.137) - identity=56.6; qcov=1; evalue=2.42e-144; confidence=high
GO	GO:0005643 (nuclear pore); GO:0006607 (NLS-bearing protein import into nucleus); GO:0006999 (nuclear pore organization); GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore); GO:0036228 (protein localization to nuclear inner membrane); GO:0044613 (nuclear pore central transport channel)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13874 (Nup54)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776939.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	1.00000	`XP_057776939.1`
3	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057776939.1`
4	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057776939.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057776939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16604882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr7:16604956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:16607558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B52,B66,B86
`Chr7:16607624`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C38
`Chr7:16607624`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C38
`Chr7:16607689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D10
`Chr7:16607757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776939.1

390 aa

195

390

Nup54

PF13874 Nup54 176-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776939.1`	Pfam	`PF13874`	Nup54	Coiled-coil	176	320	1.8e-29	103.3	Nucleoporin complex subunit 54

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920956.1
ATTAACTTTAAAATTATCATAATTTGTGCAAATACATTTACATACATGTGTGTATTTTGGTTTTGGAAGGGGAAAATGTTGCAATTATTTTACTACTTTCTAAAACGAATTTCAAAACCCTCTAACGCGGCGTCGCGTCATAAAGAAATTGGCGGCAACAGCCGCACTAGAAATTCCCAATCTCTGAATCTAGGGTTCCGCCACCCCTCCAAGAATGTTCGGAGCTCAGTCGTCCTCCCCGGCCTTCGCCACCCCTTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995602
ATGTTCGGAGCTCAGTCGTCCTCCCCGGCCTTCGCCACCCCTTCCTCCACTCCCGCATTCGGCACGCCTTCAACTCCGGCGTTCGGTTCATCGCTCTTCTCCACACCCTTTTCGCAACAATCCCAACCGCAGCAGCAGCAGCAAACTCCGTCGCTGTTTCAGACGCCTCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAAACTCCATCGCTCTTTCAGACGCCTCAGCAGCAAACTCCGTCGCTCTTTCAGACGCCTCAGCCGCAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776939.1
MFGAQSSSPAFATPSSTPAFGTPSTPAFGSSLFSTPFSQQSQPQQQQQTPSLFQTPQQQQQQQQTPSLFQTPQQQTPSLFQTPQPQQQQQQSPFGFTTPFNNAQQQQATLFNNASPTNFMNQQLTTQMAPVAPLPFSLADRDIQAIVDAYKEEPGNLKYEFKHLLFSVTEPQYRAKPAGVSDIMWAEAITKLEGMESSKRERLWPQLVQGFKDLSQRLKLQDEVILSDSERLKMTQSNVKMLQRHFQADTLPWIQRMQQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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