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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001922`

染色体: Chr07 坐标: 16646262-16647933 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001922`
名称	SmilChr07G001922
描述	uncharacterized SmilChr07G001922
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16646262 - 16647933 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995606`
GeneID	`130995606`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995606`
原始查询	`SmilChr07G001922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828447]; symbol=AT4G23490; hit=AT4G23490; species=arabidopsis; confidence=high
产物	fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828447]; symbol=AT4G23490; hit=AT4G23490; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G23490` (AT4G23490) fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828447] identity=69.4; qcov=0.755; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0578800` - identity=62.8; qcov=0.773; evalue=4.55e-174; confidence=high
GO	GO:0008375 (acetylglucosaminyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02434 (Fringe); PF04646 (DUF604)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995606

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057776943.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057776943.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776943.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776943.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776943.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16646358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:16646526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B131,B34,C65
`Chr7:16646732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:16647321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr7:16647577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776943.1

519 aa

260

519

Fringe

DUF604

PF02434 Fringe 150-304 aa PF04646 DUF604 240-493 aa

XP_057776945.1

494 aa

247

494

Fringe

DUF604

PF02434 Fringe 150-304 aa PF04646 DUF604 240-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776943.1`	Pfam	`PF02434`	Fringe	Domain	150	304	1.5e-13	51.3	Fringe-like
`XP_057776943.1`	Pfam	`PF04646`	DUF604	Family	240	493	5.3e-116	387.2	Protein of unknown function, DUF604
`XP_057776945.1`	Pfam	`PF02434`	Fringe	Domain	150	304	1.4e-13	51.5	Fringe-like
`XP_057776945.1`	Pfam	`PF04646`	DUF604	Family	240	479	2.2e-111	372.1	Protein of unknown function, DUF604

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920960.1
GAACATCTCTCCCCATGAATCTCCACTTTGATGAGGCATGCAAAAACATCATTCAGTTTTTCCCGTTTGGAAGCAAAAGCAAGCACCCAAATGAACCCCAGCGCTCACCGCCCCCTCCTCGGCTTGAGCAGCCTCCGCAGCGGCGCCACCTGCTTCTTCATCTCTATCCTCCTCCTCTACTCCATCTACTCTTCCACATTCATCATCAACACCAAAAACCACGATGACTGCCCGTCCCTCCAATCCATCTCCACCAAGGA...

XM_057920962.1
GAACATCTCTCCCCATGAATCTCCACTTTGATGAGGCATGCAAAAACATCATTCAGTTTTTCCCGTTTGGAAGCAAAAGCAAGCACCCAAATGAACCCCAGCGCTCACCGCCCCCTCCTCGGCTTGAGCAGCCTCCGCAGCGGCGCCACCTGCTTCTTCATCTCTATCCTCCTCCTCTACTCCATCTACTCTTCCACATTCATCATCAACACCAAAAACCACGATGACTGCCCGTCCCTCCAATCCATCTCCACCAAGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995606
ATGAGGCATGCAAAAACATCATTCAGTTTTTCCCGTTTGGAAGCAAAAGCAAGCACCCAAATGAACCCCAGCGCTCACCGCCCCCTCCTCGGCTTGAGCAGCCTCCGCAGCGGCGCCACCTGCTTCTTCATCTCTATCCTCCTCCTCTACTCCATCTACTCTTCCACATTCATCATCAACACCAAAAACCACGATGACTGCCCGTCCCTCCAATCCATCTCCACCAAGGAAAACCTCCAGAGTCTCGCCCCTCACCCGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776943.1
MRHAKTSFSFSRLEAKASTQMNPSAHRPLLGLSSLRSGATCFFISILLLYSIYSSTFIINTKNHDDCPSLQSISTKENLQSLAPHPPPPVLNTTTPDDGDRDHDPLKIKHVMFGIAASSSLWNKRKEYIKLWWRPEETRGVVWLDKKITISDEEAEKLPEIRISGDTSKFNYTNKQGKRSALRISRVVSETLRMGMKEVRWFVMGDDDTVFVVENVVRVLSKYDHNQLYYIGSSSESHVQNIFFSYAMAYGGGGFAISYP...

XP_057776945.1
MRHAKTSFSFSRLEAKASTQMNPSAHRPLLGLSSLRSGATCFFISILLLYSIYSSTFIINTKNHDDCPSLQSISTKENLQSLAPHPPPPVLNTTTPDDGDRDHDPLKIKHVMFGIAASSSLWNKRKEYIKLWWRPEETRGVVWLDKKITISDEEAEKLPEIRISGDTSKFNYTNKQGKRSALRISRVVSETLRMGMKEVRWFVMGDDDTVFVVENVVRVLSKYDHNQLYYIGSSSESHVQNIFFSYAMAYGGGGFAISYP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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