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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001928`

染色体: Chr07 坐标: 16681836-16682592 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001928`
名称	SmilChr07G001928
描述	uncharacterized SmilChr07G001928
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16681836 - 16682592 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993891`
GeneID	`130993891`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993891`
原始查询	`SmilChr07G001928`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=22.5; qcov=0.86; evalue=3.49e-09; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.3; qcov=0.892; evalue=3.79e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993891

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774910.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774910.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057774910.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774910.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16681835`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A25,B2,B55,B96,C23,C29,D1
`Chr7:16681859`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A1,A25,B122,B16,B40,B6,B72,C20,C33,C39,C48,C56,C67,D10
`Chr7:16681889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C73
`Chr7:16681891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B139
`Chr7:16681907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B10,B131,B29,D10
`Chr7:16681907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B131,B29,D10
`Chr7:16681920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A1,A11,B122,B13,B136,B16,B20,B31,B34,B42,B43,B51,B54,B58,C47,C49,C74,C8,C80
`Chr7:16681927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A11,A16,A19,A21,B100,B106,B114,B122,B131,B136,B17,B21,B55,B78,B95,B98,C2,C20,C21,C28,C30,C40,C43,C73,C81,D3,D4,D8
`Chr7:16681946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B16,C24,C40
`Chr7:16681961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B89,C35
`Chr7:16681966`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	49	A14,A19,A21,A22,A6,A8,B102,B11,B112,B115,B19,B26,B30,B38,B39,B4,B40,B46,B48,B53,B6,B61,B63,B64,B72,B74,B81,B83,B96,C1,C10,C12,C15,C19,C23,C24,C32,C33,C36,C41,C43,C45,C46,C53,C55,C63,C68,C74,C85
`Chr7:16681968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	126	A1,A10,A11,A13,A16,A18,A2,A20,A22,A23,A3,A5,A8,B10,B103,B107,B108,B109,B111,B112,B114,B119,B122,B123,B128,B13,B131,B134,B135,B136,B138,B14,B16,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B26,B28,B3,B31,B32,B34,B35,B37,B38,B39,B42,B43,B48,B5,B53,B54,B57,B59,B6,B61,B64,B65,B73,B78,B79,B8,B81,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B92,B93,B96,B97,C10,C11,C13,C16,C17,C18,C2,C21,C22,C23,C27,C29,C30,C31,C33,C34,C36,C39,C43,C45,C47,C48,C49,C51,C56,C61,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C71,C72,C73,C75,C77,C79,C8,C83,C84,C85,C87,D1,D3,D4,D5,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774910.1

222 aa

111

222

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 25-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774910.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	25	117	2.4e-14	54.4	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918927.1
ATGGGTGGGGGAAGTGTGGGAATGGGAGGTAAGAAAGATGGATGGAGATGGAAGCCGACAAAAGATGGAGTTTTTTCAATCAAATCGGCGTACGAAACTATTGAAACGACGAAAGGGGAGCCTGATGCGGGTAACAGTGAAGCGTTGGCTAAAGTTTGGGAAGCGCCGACTCCACATAATGCAAGGGTGACTGCATGGAGAAGCTTGAGAAACAGGTTGGCGACGTGCGACAATCTGGTGAAAAGGAATGTTCCGATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993891
ATGGGTGGGGGAAGTGTGGGAATGGGAGGTAAGAAAGATGGATGGAGATGGAAGCCGACAAAAGATGGAGTTTTTTCAATCAAATCGGCGTACGAAACTATTGAAACGACGAAAGGGGAGCCTGATGCGGGTAACAGTGAAGCGTTGGCTAAAGTTTGGGAAGCGCCGACTCCACATAATGCAAGGGTGACTGCATGGAGAAGCTTGAGAAACAGGTTGGCGACGTGCGACAATCTGGTGAAAAGGAATGTTCCGATTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774910.1
MGGGSVGMGGKKDGWRWKPTKDGVFSIKSAYETIETTKGEPDAGNSEALAKVWEAPTPHNARVTAWRSLRNRLATCDNLVKRNVPIEIEERWCNACVGYEETVEHFLLHCPKVELVWDQIQQWLNIKTVRPRGLLDHFMSFIYGGRGKKNRKFLQALWVGTIWSVWKGRNDSRFDGKVWDAHKLVLEIKGRMWSWNKTFQIVESSVPFSMWCSREYTLPFLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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