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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001931`

染色体: Chr07 坐标: 16696518-16696949 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001931`
名称	SmilChr07G001931
描述	cold shock protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16696518 - 16696949 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993892`
GeneID	`130993892`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993892`
原始查询	`SmilChr07G001931`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cold shock protein 2-like
产物	cold shock protein 2-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993892

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774911.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057774911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16696532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D10
`Chr7:16696535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B52,C80
`Chr7:16696536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B127,B34,C30,C5
`Chr7:16696544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C78,D10
`Chr7:16696552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C10
`Chr7:16696553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr7:16696578`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr7:16696578`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B82
`Chr7:16696593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C29
`Chr7:16696610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:16696630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A3,B112,C10
`Chr7:16696632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774911.1

143 aa

143

zf-CCHC

PF00098 zf-CCHC 70-85 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774911.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	70	85	0.00011	22.9	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918928.1
ATGGGTCCAAAAACATCGACCACAATCTCGTCCTTAGAACCGACGAGTAACCAAAATCGACTGCCAAGAATTGGCGGAGGACTCACCGAAGTAGTTATCGATGGTGGTGTTGGTGGTATTGTGAGTGAAGGCGGTACATCAGGGGGTGTCTGCAGCGGAGGTTGGAGAGCTAGCGATGGCAGCGGCGGTGGTGTTGACAGCGGCAACGGCTGCTTCAAGTGCGGTGAGAACGACCATGTGGCAAGGGTGTGCCCGACCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057774911.1_36893
ATGGGTCCAAAAACATCGACCACAATCTCGTCCTTAGAACCGACGAGTAACCAAAATCGACTGCCAAGAATTGGCGGAGGACTCACCGAAGTAGTTATCGATGGTGGTGTTGGTGGTATTGTGAGTGAAGGCGGTACATCAGGGGGTGTCTGCAGCGGAGGTTGGAGAGCTAGCGATGGCAGCGGCGGTGGTGTTGACAGCGGCAACGGCTGCTTCAAGTGCGGTGAGAACGACCATGTGGCAAGGGTGTGCCCGACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774911.1
MGPKTSTTISSLEPTSNQNRLPRIGGGLTEVVIDGGVGGIVSEGGTSGGVCSGGWRASDGSGGGVDSGNGCFKCGENDHVARVCPTEGGGGRYSGGGVGSIGSEGGTFGGGGEEVGDQHTSGAVAGGNLLVAGKFASKEDCRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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