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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001935`

染色体: Chr07 坐标: 16760376-16763325 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001935`
名称	SmilChr07G001935
描述	flavonoid 3',5'-methyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16760376 - 16763325 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995615`
GeneID	`130995615`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995615`
原始查询	`SmilChr07G001935`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flavonoid 3',5'-methyltransferase-like
产物	flavonoid 3'%2C5'-methyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G67980` (CCOAMT) caffeoyl-CoA 3-O-methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843126] identity=62; qcov=0.966; evalue=4.59e-98; confidence=high
Rice	`Os06g0165800` (ROMT-16) - identity=56.8; qcov=0.979; evalue=8.67e-95; confidence=high
GO	GO:0008171 (O-methyltransferase activity); GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity)
KEGG	smil00944 (Flavone and flavonol biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01596 (Methyltransf_3); PF13578 (Methyltransf_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995615

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776951.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057776951.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776951.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776951.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776951.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16763003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr7:16763062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr7:16763098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr7:16763107`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B106
`Chr7:16763107`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B106
`Chr7:16763163`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr7:16763163`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776951.1

234 aa

117

234

Methyltransf_3

Methyltransf_24

PF01596 Methyltransf_3 21-233 aa PF13578 Methyltransf_24 72-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776951.1`	Pfam	`PF01596`	Methyltransf_3	Domain	21	233	1.9e-81	272.9	O-methyltransferase
`XP_057776951.1`	Pfam	`PF13578`	Methyltransf_24	Domain	72	177	2.6e-12	48.3	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920968.1
ACTAACCATTAACCCACCCAAAATCGAATCGAATATCGACTATAATAAAAAATAAATTATTGAATAAATATATAGGAGCGTAGTTGTTGTCTGTGACACTTCTTCTAAATAGAGGCTTTAACGCGTTGTTTGTAGCTTTATAAATTGCCTCATTATTTCAAACAAACATATTAATTCTCCCACCCTTAATTATCATTCATCTTTTTGGGTTTCAAAATGAAGAACAAGTACTATGGCTCCATTCTTCAGAGCGAAGCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995615
ATGAAGAACAAGTACTATGGCTCCATTCTTCAGAGCGAAGCCCTCGCTAAGTATATTCTGGAAACAAGTGCTTTTCCCAGAGAGCACGAACAGCTCAAAGAGATCAGGACAGCTACCGTTGACAAGTATAAATTTTGGAGTCTAATGAATGTGCCTGCCGATGAAGGCCAGTTTATTTCTATGCTCTTGAAAACTATGAATGCCAAAAAGACATTAGAAGTTGGAGTTTTTACCGGTTACTCACTTCTCACCACTGCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776951.1
MKNKYYGSILQSEALAKYILETSAFPREHEQLKEIRTATVDKYKFWSLMNVPADEGQFISMLLKTMNAKKTLEVGVFTGYSLLTTALALPDDGRIIAIDPDREAYEVGLPFIEKANMTHKIQFIQSDAMTVIKDLLSKGEEGTFDYAFVDADKENYINYHEQLLKLVKVGGIIAYDNTLWSGTVVAAEDAEMDQFLRGCRGHILTLNSFLAADSRIELAQLSIGDGLTLCRRLT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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