当前解析结果
SmilChr07G001946| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001946 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001946 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001946 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 16876687 - 16877687 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995625 |
|---|---|
| GeneID | 130995625 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995625 |
| 原始查询 | SmilChr07G001946 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005507 (copper ion binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995625 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057776965.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776965.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776965.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057776965.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057776965.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:16876829 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C42,C77 |
Chr7:16876955 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr7:16877184 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B24,B95 |
Chr7:16877190 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 14 | B119,B121,B122,B133,B42,B43,B52,B59,B81,B98,C29,C55,C79,D9 |
Chr7:16877234 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B66,B94,C66,D9 |
Chr7:16877287 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr7:16877293 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr7:16877487 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
Chr7:16877591 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。