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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001947`

染色体: Chr07 坐标: 16877673-16879910 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001947`
名称	SmilChr07G001947
描述	uncharacterized SmilChr07G001947
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16877673 - 16879910 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993897`
GeneID	`130993897`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993897`
原始查询	`SmilChr07G001947`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=26.2; qcov=0.701; evalue=3.77e-41; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=33.5; qcov=0.83; evalue=1.88e-82; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993897

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774916.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774916.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774916.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774916.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774916.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16877673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C6,C81
`Chr7:16877875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:16877886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C20
`Chr7:16877908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B69,C1,C25,C44
`Chr7:16877977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B5,B52,C11,C21,C78
`Chr7:16877983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B63,C10,C36
`Chr7:16877994`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C10,C46
`Chr7:16877994`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C10,C46
`Chr7:16878024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B4,C20,D8
`Chr7:16878110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,D11
`Chr7:16878125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B69,C64,C66
`Chr7:16878157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774916.1

665 aa

332

665

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 414-508 aa PF00872 Transposase_mut 432-563 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774916.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	414	508	9e-16	58.8	MULE transposase domain
`XP_057774916.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	432	563	2.3e-06	27.5	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918933.1
ATGGGGAAAGAGAATGCAGGTGAAGTGGGGAAAGGGAAGACAATAGGAAAGGGAAAAGAGAAGTTGAGTAGACCCGAGAAGAAGAAGGTGAATAATCCAGTGGGAACTTCTCCCATTACTAGAAGTAAGAAGGTTATAGATGAAGGACAAGGTAGTGTTTCAGTAAGAACCTCTCCTATAACTAGAAGTAGGAAGGTGTTAGGATTGGGAGAGAATAGTTTGCCAGTGGAGACTACACCCAAGAAAAAGGGTAAGAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993897
ATGGGGAAAGAGAATGCAGGTGAAGTGGGGAAAGGGAAGACAATAGGAAAGGGAAAAGAGAAGTTGAGTAGACCCGAGAAGAAGAAGGTGAATAATCCAGTGGGAACTTCTCCCATTACTAGAAGTAAGAAGGTTATAGATGAAGGACAAGGTAGTGTTTCAGTAAGAACCTCTCCTATAACTAGAAGTAGGAAGGTGTTAGGATTGGGAGAGAATAGTTTGCCAGTGGAGACTACACCCAAGAAAAAGGGTAAGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774916.1
MGKENAGEVGKGKTIGKGKEKLSRPEKKKVNNPVGTSPITRSKKVIDEGQGSVSVRTSPITRSRKVLGLGENSLPVETTPKKKGKKKQVTRTLVDEPIIETDPEDSDYIIPEDGEQYETDDSLGDNELGSDDEEYRDARLNLRLVEGVVQEREEGDLPDDVSMSEGRSADPRGSNTEGDEGMLSDYIVSDGDVVSDSTDEEEGSKRLPRIMYDPRCNHKDLIVQIGLRFENGYQCKEALRSWAILKGYPIRFRRVSKKQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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