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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001948`

染色体: Chr07 坐标: 16890354-16890983 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001948`
名称	SmilChr07G001948
描述	uncharacterized SmilChr07G001948
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16890354 - 16890983 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993898`
GeneID	`130993898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993898`
原始查询	`SmilChr07G001948`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=31; qcov=0.957; evalue=5.71e-16; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=32.3; qcov=0.919; evalue=3.45e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774917.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774917.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774917.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774917.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774917.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16890416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:16890426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B100,D10
`Chr7:16890426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D10
`Chr7:16890433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B140,B3,D1
`Chr7:16890459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr7:16890462`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A1,A16,A18,A2,B1,B10,B102,B12,B120,B127,B2,B35,B38,B39,B44,B69,B72,B74,B93,C2,C32,C43,C45,C68,C72,C73,C75,C77
`Chr7:16890476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,B104
`Chr7:16890489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr7:16890514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B81,C1
`Chr7:16890537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:16890545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C81
`Chr7:16890550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774917.1

209 aa

104

209

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 15-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774917.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	15	108	6.1e-19	69.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918934.1
ATGAAAGATTGTTGGAGGTGGAAACCTACCCCCAACGGCTTGTTTACAGTAAATTCAGCATACAAAGCTATCCGACAAGCAAGATTGGAGAATGGGATTAATTGTGAGCAAATGGATTTCAAGAAACTGTGGAAGGCTCCAGCTCATCACAAGATGAAAACAACAGCTTGGAGGATTTTTAAAGGAAGATTGGCGACGTGCGATAATCTCACCCGAAGAAACATTTTGGCTGCTAATTCGACCTCCGATTGCATTCTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993898
ATGAAAGATTGTTGGAGGTGGAAACCTACCCCCAACGGCTTGTTTACAGTAAATTCAGCATACAAAGCTATCCGACAAGCAAGATTGGAGAATGGGATTAATTGTGAGCAAATGGATTTCAAGAAACTGTGGAAGGCTCCAGCTCATCACAAGATGAAAACAACAGCTTGGAGGATTTTTAAAGGAAGATTGGCGACGTGCGATAATCTCACCCGAAGAAACATTTTGGCTGCTAATTCGACCTCCGATTGCATTCTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774917.1
MKDCWRWKPTPNGLFTVNSAYKAIRQARLENGINCEQMDFKKLWKAPAHHKMKTTAWRIFKGRLATCDNLTRRNILAANSTSDCILCKAQLEDLNHLFFSCQITMELWKEILSWIGIQTALQRTAKENFLAFSNLGDKADNHFLSSVWICVVWSIWKARNDCIFSQASWNKSKVVTEIKTRTLSWTQVYKQTPQPLDFKSWMIKPKVME

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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