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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001953`

染色体: Chr07 坐标: 16989104-16991803 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001953`
名称	SmilChr07G001953
描述	alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16989104 - 16991803 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995629`
GeneID	`130995629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995629`
原始查询	`SmilChr07G001953`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB
产物	alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB
Arabidopsis	`AT1G11780` (AT1G11780) oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837723] identity=64.9; qcov=1.01; evalue=5.7e-171; confidence=high
Rice	`Os11g0488500` - identity=66.5; qcov=0.669; evalue=7.28e-110; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008198 (ferrous iron binding); GO:0035513 (oxidative RNA demethylation); GO:0035515 (oxidative RNA demethylase activity); GO:0035516 (broad specificity oxidative DNA demethylase activity); GO:0035552 (GO:0035552)
KEGG	-
Pfam	PF13532 (2OG-FeII_Oxy_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776969.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057776969.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776969.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057776969.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776969.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16989347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B82,C39
`Chr7:16989631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:16989662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:16989685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr7:16989859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:16990812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B35,B44
`Chr7:16990928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:16991008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:16991054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776969.1

357 aa

178

357

2OG-FeII_Oxy_2

PF13532 2OG-FeII_Oxy_2 177-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776969.1`	Pfam	`PF13532`	2OG-FeII_Oxy_2	Domain	177	354	4.2e-40	138.8	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920986.1
CTTAAACAATATCCATTCACATTGTCGTGGCAAGATTTCATTGCAGGTGCAGCTGAACACCAAAAACTGCGCCACACCTTATCGTCGCTCTAATTTTAGCCCGAATCCAACATTTAGTTAATTTGATGCAATGTTTTTACTGCAAAACCCTAGAGTAGCCAAATTCCCAATTTCAGTTTCTCTTGCTTCTCATAATGTACCGATCAGAGGTTACCAGCGAAGAATCAGAGCGGACAGCTTTCCGAAAAGCAGAAAAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995629
ATGTACCGATCAGAGGTTACCAGCGAAGAATCAGAGCGGACAGCTTTCCGAAAAGCAGAAAAGAAATACAAAATCTATTACGATAGCACCAAAAAGAAAAAGCTAACAAGACCTGTGGATTTATCAGAGGTCATAGATTTCAAGTCAATTTTAGATTATTATAATTACAACGGTGAACTTAAGGATGGAGTTTCGGTACTAAATTGTGATTTTGATCGACCTATTTTCTGCTTGGAAAGTCGGCCAGGTTTCTATTTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776969.1
MYRSEVTSEESERTAFRKAEKKYKIYYDSTKKKKLTRPVDLSEVIDFKSILDYYNYNGELKDGVSVLNCDFDRPIFCLESRPGFYFIPDALNIEEQCQWIRESLTSFPQPPNRTNHNAVYGHIEDLFVSANERRVLVEVERLPDDACSELIAMQSDVCTPRYKFIEEHNESHSKDVGKSVPASVLLRKLRWSTLGLQFDWSKRSYNISLPHKKIPDALCQLAKRMAAPAMPCGEEFLPEAAIVNYFGIGDMLGGHLDDME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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