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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001959`

染色体: Chr07 坐标: 17060875-17066439 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001959`
名称	SmilChr07G001959
描述	interactor of constitutive active ROPs 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17060875 - 17066439 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993900`
GeneID	`130993900`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993900`
原始查询	`SmilChr07G001959`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	interactor of constitutive active ROPs 3-like
产物	interactor of constitutive active ROPs 3-like
Arabidopsis	`AT2G37080` (RIP2) ROP interactive partner 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818284] identity=40; qcov=0.579; evalue=1.22e-25; confidence=medium
Rice	`Os05g0122600` - identity=37.6; qcov=0.599; evalue=2.4e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993900

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774919.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774919.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774919.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774919.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774919.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17060883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:17062647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C13,C60
`Chr7:17062752`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A18,B107,B115,B125,B17,B26,B31,B39,B48,B64,B66,B71,B76,B8,B90,B92,B97,C13,C20,C3,C38,C5,C54,C62,C77,C86,D6
`Chr7:17062796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B79
`Chr7:17062810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B137,B66,B8
`Chr7:17062812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B66,B99,C37
`Chr7:17063802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B84,C11
`Chr7:17064205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:17064673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918936.1
ATGTATCGGTCGAAGATAGGAGGCATGCACACGACCCTTAAAGATAGGAACCCCAAGGTAGACACTCACATTCAACAGCTTGATCAATATTTGAAGAAATTTGATGAGGATCTTCGGCGTGTTGCAGAGTGCCCATCTGCCACTGTGTACAATGAATTTATATCATGTTTCTCACAGTTTCTGTATCTTTTGAGGGCGGAAGAAGACGCGCCTTGCAACAGCAAATGCAGCTGCCTCCTAGACAAAGCAATCAAGGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993900
ATGTATCGGTCGAAGATAGGAGGCATGCACACGACCCTTAAAGATAGGAACCCCAAGGTAGACACTCACATTCAACAGCTTGATCAATATTTGAAGAAATTTGATGAGGATCTTCGGCGTGTTGCAGAGTGCCCATCTGCCACTGTGTACAATGAATTTATATCATGTTTCTCACAGTTTCTGTATCTTTTGAGGGCGGAAGAAGACGCGCCTTGCAACAGCAAATGCAGCTGCCTCCTAGACAAAGCAATCAAGGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774919.1
MYRSKIGGMHTTLKDRNPKVDTHIQQLDQYLKKFDEDLRRVAECPSATVYNEFISCFSQFLYLLRAEEDAPCNSKCSCLLDKAIKEKVQNNQGKGEENSELILEALFSYDLENDLKNVKDQLCSSEKSKKQAQRDADESNQELSVLSSKLEESEKKLLELSASRNALTVELSETSEERDRSLQAELEALHKQQLQESAALASALDEIERLKAQLAMVAASEANNSESAPTELHNLNEALVVVEEMKKQLSDSKKSEAEAQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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