当前解析结果
SmilChr07G001962| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001962 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001962 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001962 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 17140114 - 17141300 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995637 |
|---|---|
| GeneID | 130995637 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995637 |
| 原始查询 | SmilChr07G001962 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os11g0637501; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os11g0637501; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G27350 (AT1G27350)Ribosome associated membrane protein RAMP4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839624] identity=73.5; qcov=1; evalue=1.27e-32; confidence=medium |
| Rice | Os11g0637501- identity=75; qcov=1; evalue=3.18e-33; confidence=medium |
| GO | GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0030968 (endoplasmic reticulum unfolded protein response) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF06624 (RAMP4) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995637 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057776984.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057776984.1 |
| 3 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.60000 | XP_057776984.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.60000 | XP_057776984.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057776984.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057776984.1PF06624
RAMP4 5-62 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057776984.1 |
Pfam | PF06624 |
RAMP4 | Family | 5 | 62 | 1.5e-23 | 83.3 | Ribosome associated membrane protein RAMP4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。