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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001987`

染色体: Chr07 坐标: 17526492-17527683 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001987`
名称	SmilChr07G001987
描述	uncharacterized SmilChr07G001987
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17526492 - 17527683 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995653`
GeneID	`130995653`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995653`
原始查询	`SmilChr07G001987`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831148]; symbol=AT5G13090; hit=AT5G13090; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831148]; symbol=AT5G13090; hit=AT5G13090; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G13090` (AT5G13090) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831148] identity=39.5; qcov=1.21; evalue=1.8e-48; confidence=medium
Rice	`Os11g0490300` - identity=37.9; qcov=0.689; evalue=1.18e-25; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28924 (DUF8481)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995653

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777003.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777003.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057777003.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777003.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777003.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17526822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:17526885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C14
`Chr7:17526914`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr7:17526914`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr7:17527207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:17527302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr7:17527314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B8,C58
`Chr7:17527340`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A2,B118,B131,B56,B96,C35,C65,C69,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777003.1

222 aa

111

222

DUF8481

PF28924 DUF8481 27-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777003.1`	Pfam	`PF28924`	DUF8481	Domain	27	130	4.7e-46	156.2	Domain of unknown function (DUF8481)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921020.1
TGCTTGGGTAAGATAAAGAAAAATAATTTTTGTTAAGTCTGAATAAAATTAGAATCTGGTATGTTAAACTATATGCTTATATAAGTGAAGAACGTTTATTTAAAGTATGTATCCCACTTTCAAAATTAACATTTTAGACCGTCCATATCTGAGATAGATACCTCCCTCAAAACCCACCAAACCGACCCCTCCCCTAAAAAAAATAAAAAATAAAAAGAGAAAAATATTTACCCTAAACTTGAATTCGTATTACACCTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995653
ATGAAGATGAGAAACAAAGGCAAAGTCCATCCCTTCACTTCATCATCATCTTCTTCGTCTTCTTCTCTCCCTCCCACCAACACAGACGCTTTCTCTCTCCTCAAACTCCTCCCCGCCGCCATTCTCACTCTAGTATCCTTTCTCTCTCTAGAAGAGCGCGAGGTCCTGGCCTACATGATCACCAGATCCCTCAAATCCCCCAACCCCTCCTCCCTCCCCGCCACCGAAGATAAGAAGAAGCAGTGCGGCCACAACTCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777003.1
MKMRNKGKVHPFTSSSSSSSSSLPPTNTDAFSLLKLLPAAILTLVSFLSLEEREVLAYMITRSLKSPNPSSLPATEDKKKQCGHNSPALFDCDCFHCYTSFWFRWDSSPNRELIHQAIEAFEDHLNSGGTLNNSPKTKRRDKLGRRNKPPADPLPSSPPENQERPIPADLPQLHELSGENAAEPPPSPAAVVRTHKGLARKVLPDVMGIFSSRLWSLWSPNV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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