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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001990`

染色体: Chr07 坐标: 17551531-17553099 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001990`
名称	SmilChr07G001990
描述	transcription factor TGA4-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17551531 - 17553099 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995656`
GeneID	`130995656`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995656`
原始查询	`SmilChr07G001990`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TGA4-like
产物	transcription factor TGA4-like
Arabidopsis	`AT5G10030` (TGA4) TGACG motif-binding factor 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830866] identity=66.7; qcov=0.935; evalue=1.68e-31; confidence=medium
Rice	`Os04g0637000` (OsTGAP1) - identity=60.7; qcov=0.957; evalue=9.38e-28; confidence=medium
GO	GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995656

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777006.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777006.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057777006.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777006.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777006.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17552617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D7
`Chr7:17552623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:17552634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:17552638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr7:17552641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,D3
`Chr7:17552642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:17552651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:17552676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:17552680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C83
`Chr7:17552687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B6
`Chr7:17552693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:17552696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B115,B54

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092236.1
TTTATTATAAAAAATGAATGGTCTATGTTTTAAATACATCTCTCTCTCTCCTTACGCTGAGAGCTCCTCATCTCTCTCGATATGTTTCCGGCGAGGAATCCGGCGCCGCAGCCGTCGACCATCTCTTTCATCTGAATCGTGCCCTAGCTCTTCCTCAAATCCTCTGGAAAAGGCGAAGATGAAAAGCCCCAATTTTTCTCCTTCATCTGAATCGTGCCCTAGCTCTTCCTCTGCCCAAATCGTCGCCGCCCTGCTACAAC...

XM_057921023.1
TAAAAAATGAATGGTCTATGTTTTAAATACATCTCTCTCTCTCCTTACGCTGAGAGCTCCTCATCTCTCTCGATATGTTTCCGGCGAGGAATCCGGCGCCGCAGCCGTCGACCATCTCTTTCATCTGAATCGTGCCCTAGCTCTTCCTCAAATCCTCTGGAAAAGGCGAAGATGAAAAGCCCCAATTTTTCTCCTTCATCTGAATCGTGCCCTAGCTCTTCCTCTGCCCAAATCGTCGCCGCCCTGCTACAACTTCCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995656
ATGGAGAAGCTCCAGCAGACCCTCGCGCAGAGCGTCACCTTCCTGCATCCGGGAGCAGGAAACTACTGCTCCCAGGCCGCCTTTGCCCTCGAGAACTTGGAGTCTCTCGAGAGCTTCATAAACCAGGCGGATCATCTGCGACAGCAAACTCTACAGCACATGTCGCGTATATTAACTACGCGACAAGCAGCCACCGGATTGGTTGCGTTCGGGGAGTATTTTCAGCGTCTGAGGACGCTGAGCTCGCTCTGGTCCGCCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777006.1
MEKLQQTLAQSVTFLHPGAGNYCSQAAFALENLESLESFINQADHLRQQTLQHMSRILTTRQAATGLVAFGEYFQRLRTLSSLWSARCPGEPA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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