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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001995`

染色体: Chr07 坐标: 17643598-17645226 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001995`
名称	SmilChr07G001995
描述	transcription factor TCP20-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17643598 - 17645226 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995660`
GeneID	`130995660`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995660`
原始查询	`SmilChr07G001995`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP20-like
产物	transcription factor TCP20-like
Arabidopsis	`AT3G27010` (TCP20) TEOSINTE BRANCHED 1, cycloidea, PCF (TCP)-domain family protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822318] identity=51.9; qcov=0.849; evalue=4.93e-54; confidence=high
Rice	`Os01g0924400` (OsTCP6) - identity=45.6; qcov=0.878; evalue=5.19e-50; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995660

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777012.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777012.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777012.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777012.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777012.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17644049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B68,B90,C26
`Chr7:17644077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:17644095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B52,C23
`Chr7:17644129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B68,B90,B92,C26
`Chr7:17644131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C44,C80
`Chr7:17644161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B68,B90,B92,C26
`Chr7:17644173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C59
`Chr7:17644346`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A9,B111,B25,B32,B62
`Chr7:17644346`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A9,B111,B25,B32,B62
`Chr7:17644430`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	40	A21,A25,A3,A4,A6,B10,B101,B104,B105,B11,B126,B129,B14,B140,B27,B29,B33,B34,B45,B54,B56,B58,B7,B86,B93,C15,C30,C34,C51,C53,C54,C63,C65,C7,C83,C85,C9,D10,D2,D9
`Chr7:17644439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,C7,C83,C9,D2
`Chr7:17644461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B140,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777012.1

245 aa

122

245

TCP

PF03634 TCP 53-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777012.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	53	135	7.2e-26	92.3	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921029.1
AATAAACAGCCCATCATTTTTCACGCAAACTTGTCCATTCATAATTGCTGTGATGAATTAAACACTCTAATAATTACTGGGGAGACAACTAACTGATCATAGGACTAACAAAAAACCCTTTTCCTTCACTCTCACTATTCAACACCATTACAATAATAAATATCAAATTAAATAAAAAAAATATTTATCATCTCCATGATTACAGTCACTGTGCTGAGTGACAACGACCACCCAATTTGAAAGAGAGAGAGAGAGAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995660
ATGAATGAAGAGGCCCCATTTCTCGGCTCTTGTGATGCCATGGAACACAAACCCTCAAACTCAAAGTCTGAAGATGCTCCGCCAATTTTCCCCCAACCAAACATGGCGCTAGCCAAGCTCGACGACTCCAAGAAGAAGCAGCTCGCGCCCAAGCGGACCTCCAACAAGGACCGCCACAAGAAGGTCGAGGGCCGCGGCCGCCGGATCAGGATTCCGGCTCTCTGCGCCGCCAGGATTTTCCAGCTCACGCGGGAGCTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777012.1
MNEEAPFLGSCDAMEHKPSNSKSEDAPPIFPQPNMALAKLDDSKKKQLAPKRTSNKDRHKKVEGRGRRIRIPALCAARIFQLTRELGHKTDGETIQWLLQQAEPSIIAATGTGTIPASALGGAGPSVSEQGSSVSAGVYSRLVESGMGIRASSISMMNEGIWPSFNGFGSTIFQNSNIQSANRGVKLGFEFPVPGLELGLSQEGQIGGLNLQAFSHFYQQIGVQNGDCSGGDQNQGKENSQGSRH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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