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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002000`

染色体: Chr07 坐标: 17703999-17711969 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002000`
名称	SmilChr07G002000
描述	protein ESSENTIAL FOR POTEXVIRUS ACCUMULATION 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17703999 - 17711969 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995664`
GeneID	`130995664`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995664`
原始查询	`SmilChr07G002000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ESSENTIAL FOR POTEXVIRUS ACCUMULATION 1-like
产物	protein ESSENTIAL FOR POTEXVIRUS ACCUMULATION 1-like
Arabidopsis	`AT1G27430` (AT1G27430) GYF domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839633] identity=38.2; qcov=1.07; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os01g0924600` - identity=31.3; qcov=0.322; evalue=7.63e-28; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF02213 (GYF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995664

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777015.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057777015.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057777015.1`
4	P-body	P-body	0.60000	`XP_057777015.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057777015.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17704255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:17704336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr7:17704499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C72
`Chr7:17704530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B64,C48
`Chr7:17705042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C87
`Chr7:17705826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:17706240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr7:17706603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr7:17706604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B88,B94,C25
`Chr7:17706664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:17707240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr7:17707619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777015.1

1563 aa

782

1563

GYF

PF02213 GYF 530-571 aa

XP_057777016.1

1561 aa

780

1561

GYF

PF02213 GYF 530-571 aa

XP_057777017.1

1532 aa

766

1532

GYF

PF02213 GYF 530-571 aa

XP_057777018.1

1530 aa

765

1530

GYF

PF02213 GYF 530-571 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777015.1`	Pfam	`PF02213`	GYF	Domain	530	571	4.2e-12	46.3	GYF domain
`XP_057777016.1`	Pfam	`PF02213`	GYF	Domain	530	571	4.2e-12	46.3	GYF domain
`XP_057777017.1`	Pfam	`PF02213`	GYF	Domain	530	571	4.1e-12	46.3	GYF domain
`XP_057777018.1`	Pfam	`PF02213`	GYF	Domain	530	571	4.1e-12	46.3	GYF domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921035.1
GATTTGGCTGTTCTGACCACCCAAACCCTCACCCTCTCTGTTTTTCCTCTTCCTTCACATTTTCTCTCTCTGCATTTTCCAATTGCTCTCACAAACCCTAATTCTCGCTCTACCTATACATAACTCATATGTATACATCCCTCAATTTGCCTCTGGAATCTGTTTCACTCTGATAGTTCTGTATCGCCAGTCGCCGATTCACTTCTCTCTCAATCTTGCTCTCACTATTTGTGTGTTTTGTGTGTGATTCTCCGTTCGAG...

XM_057921034.1
GATTTGGCTGTTCTGACCACCCAAACCCTCACCCTCTCTGTTTTTCCTCTTCCTTCACATTTTCTCTCTCTGCATTTTCCAATTGCTCTCACAAACCCTAATTCTCGCTCTACCTATACATAACTCATATGTATACATCCCTCAATTTGCCTCTGGAATCTGTTTCACTCTGATAGTTCTGTATCGCCAGTCGCCGATTCACTTCTCTCTCAATCTTGCTCTCACTATTTGTGTGTTTTGTGTGTGATTCTCCGTTCGAG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130995664
ATGTCGGAAAGTAAGCTAGATCTTCCGGAGGATCTCATCGGTTCGAAGCCGTCCGATCAATCGTGGATTCCGAAAGCTTCCACTGGAAATGATGAGGACAAGGGGTTGGTTGGATTACTGGATGAGTCAAAGGATCAAGCAGCATCTGAGAGCATTCCGTTGTCTCCGCAGTGGCTGTATGCTAAGCCTAATGAACCTAAAATGGAAGCTCGTGGCCCAAGTTCTCTGTCTCTTGGAACCTCTGCTGATTTGAACCAAAA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057777015.1
MSESKLDLPEDLIGSKPSDQSWIPKASTGNDEDKGLVGLLDESKDQAASESIPLSPQWLYAKPNEPKMEARGPSSLSLGTSADLNQKEVWRSDAPEDKKDWRRIAPEPDSGRRWREEERETGLLGRRDRRKVDRRADNAPGREPTDNRSLPATDRWHDANNRSAGHETRRDSKWSLRWGPDDKEKDSRVEKRTDVEKEESQNESQSFVSNSRLGPERETDSRDKWRPRHRMEGNPAGSGQRSAPGFGPERGRVDGSNVGF...

XP_057777016.1
MSESKLDLPEDLIGSKPSDQSWIPKASTGNDEDKGLVGLLDESKDQAASESIPLSPQWLYAKPNEPKMEARGPSSLSLGTSADLNQKEVWRSDAPEDKKDWRRIAPEPDSGRRWREEERETGLLGRRDRRKVDRRADNAPGREPTDNRSLPATDRWHDANNRSAGHETRRDSKWSLRWGPDDKEKDSRVEKRTDVEKEESQNESQSFVSNSRLGPERETDSRDKWRPRHRMEGNPAGSGQRSAPGFGPERGRVDGSNVGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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