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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002006`

染色体: Chr07 坐标: 17803046-17807184 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002006`
名称	SmilChr07G002006
描述	protein MICRORCHIDIA 7-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17803046 - 17807184 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995667`
GeneID	`130995667`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995667`
原始查询	`SmilChr07G002006`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MICRORCHIDIA 7-like
产物	protein MICRORCHIDIA 7-like
Arabidopsis	`AT4G24970` (AT4G24970) Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828599] identity=58.3; qcov=0.862; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0469300` (OJ1057_F01.26-2) - identity=58.6; qcov=0.695; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF02518 (HATPase_c); PF13589 (HATPase_c_3); PF17942 (Morc6_S5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995667

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777022.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057777022.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057777022.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777022.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17803149`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B24,B33,B72,C53
`Chr7:17803149`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B24,B33,B72,C53
`Chr7:17803152`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B24,B33,B72,C53
`Chr7:17803152`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B24,B33,B72,C53
`Chr7:17803209`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	B105,B125,B13,B130,B18,B22,B23,B30,B47,B50,B89,C15,C21,C35,C41,C43,C50,C54,C58,C6,C60,C62,C79,D4,D9
`Chr7:17803249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr7:17804662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B28,B86,C76,C84
`Chr7:17805633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B140,C77
`Chr7:17805715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B32,C24,C3
`Chr7:17806163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777022.1

695 aa

348

695

HATPase_c_3

HATPase_c

Morc6_S5

PF13589 HATPase_c_3 149-245 aa PF02518 HATPase_c 150-229 aa PF17942 Morc6_S5 379-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777022.1`	Pfam	`PF13589`	HATPase_c_3	Domain	149	245	7.4e-18	65.6	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
`XP_057777022.1`	Pfam	`PF02518`	HATPase_c	Domain	150	229	1.1e-06	29.7	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
`XP_057777022.1`	Pfam	`PF17942`	Morc6_S5	Domain	379	524	1.4e-57	194.3	Morc6 ribosomal protein S5 domain 2-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921039.1
TCTCCATACAAACCAAACCCTCTCATTTCTCTTTTAATTTAAGCATTAATTCAATACTGAAAAACCCTTGCTCACGTAATGGATGCTTACATCAAGCAAGAAACGCTCGAGCCGGAACGACGACAAGTTATTTCGTTGAGCAGTAGCAGCAGCAGCGGCGGCAGCGACAGCGACAGCGACGTCGAACTCAACCCCAATAAGAAGCGCCGAATGGAAGCGCTCTTGCCGGTCGGCTTTCTCGACCCTATCCGCCCGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995667
ATGGATGCTTACATCAAGCAAGAAACGCTCGAGCCGGAACGACGACAAGTTATTTCGTTGAGCAGTAGCAGCAGCAGCGGCGGCAGCGACAGCGACAGCGACGTCGAACTCAACCCCAATAAGAAGCGCCGAATGGAAGCGCTCTTGCCGGTCGGCTTTCTCGACCCTATCCGCCCGCCGCCCGTCCATGGCTATGAATCCGTGGTTAGGGTAAAGCAAGAAAATGTAATTGAAAAAGAGAAGCATGTTACCGAGGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777022.1
MDAYIKQETLEPERRQVISLSSSSSSGGSDSDSDVELNPNKKRRMEALLPVGFLDPIRPPPVHGYESVVRVKQENVIEKEKHVTEVAPVTAVAPVTTVAVMSSCKQFWKAGDYEGCANGANLYDEEMDHVRVHPKFLHSNATSHKWALGAFAELLDNALDEYCNGATYVDVDMVENRKDKTKMVVVQDNGGGMTPEKMRQCMSLGYSAKSKISSTIGQYGNGFKTSTMRLGADVIVFSRCQGKYGRSSMQSIGLLSYTFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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