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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002012`

染色体: Chr07 坐标: 17953513-17955662 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002012`
名称	SmilChr07G002012
描述	RHOMBOID-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17953513 - 17955662 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993919`
GeneID	`130993919`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993919`
原始查询	`SmilChr07G002012`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RHOMBOID-like protein 3
产物	RHOMBOID-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G07250` (RBL3) RHOMBOID-like protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830616] identity=67.4; qcov=0.601; evalue=1.05e-79; confidence=high
Rice	`Os10g0521900` (OsRhmbd17) - identity=65.3; qcov=0.605; evalue=7.38e-83; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006508 (proteolysis); GO:0016020 (membrane); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	-
Pfam	PF00012 (HSP70); PF01694 (Rhomboid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993919

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057774937.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057774937.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057774937.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057774937.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057774937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17953616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:17953618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:17953623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B12,C23,C35,C40
`Chr7:17953664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,D10
`Chr7:17953843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B13,C2,D10
`Chr7:17953959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B95,C29,C54
`Chr7:17953964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr7:17954044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C77
`Chr7:17954343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr7:17954669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:17954736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B67,C2,C45
`Chr7:17954762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774937.1

291 aa

146

291

HSP70

Rhomboid

PF00012 HSP70 24-104 aa PF01694 Rhomboid 117-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774937.1`	Pfam	`PF00012`	HSP70	Family	24	104	8.1e-19	68.0	Hsp70 protein
`XP_057774937.1`	Pfam	`PF01694`	Rhomboid	Domain	117	215	2.3e-21	77.2	Rhomboid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918954.1
ATGACGACTCCTCGCCGCCACAGCGTGGCAGTGTGGCGGCACGACGACGTTGAGATCATACCCAACTATCAAGATGCGAAGAGGCTGATCGGCCGCAAATTCAGTGATCCAACGGTTAAGTGTGACGTAAAACTTTGGCCATTCAAGGTCATTCCTAACCCCACCGACAGGCCTATGATGGTAGTAGCATACAAAGGGGAGGAGAAACAGTTAACATATGAAGAGATCTCCTCAATGGTGCTCACCAAGATGAAGGATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993919
ATGACGACTCCTCGCCGCCACAGCGTGGCAGTGTGGCGGCACGACGACGTTGAGATCATACCCAACTATCAAGATGCGAAGAGGCTGATCGGCCGCAAATTCAGTGATCCAACGGTTAAGTGTGACGTAAAACTTTGGCCATTCAAGGTCATTCCTAACCCCACCGACAGGCCTATGATGGTAGTAGCATACAAAGGGGAGGAGAAACAGTTAACATATGAAGAGATCTCCTCAATGGTGCTCACCAAGATGAAGGATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774937.1
MTTPRRHSVAVWRHDDVEIIPNYQDAKRLIGRKFSDPTVKCDVKLWPFKVIPNPTDRPMMVVAYKGEEKQLTYEEISSMVLTKMKDTVDAYLGSTEKNVVVTLPKLTFIFLICVYAVRVGVINLLSGIGGSILSSIFIRNTISLGASSALFGLLGAMLSELFTNWTIYTNKAVALYTLIVIIAINLAVGILPPVDNFAHIGGFLSGFLLEFVLFARPQFGWLESRNRPTDTRLKSKYTVYQYVFWIAATILLIVGFIVGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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