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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002014`

染色体: Chr07 坐标: 17965898-17967369 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002014`
名称	SmilChr07G002014
描述	leucine-rich repeat protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17965898 - 17967369 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991171`
GeneID	`130991171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991171`
原始查询	`SmilChr07G002014`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat protein 1-like
产物	leucine-rich repeat protein 1-like
Arabidopsis	`AT3G43740` (AT3G43740) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823485] identity=60.9; qcov=0.657; evalue=1.16e-43; confidence=medium
Rice	`Os03g0440900` (OsI-BAK1) - identity=46.8; qcov=0.977; evalue=1.73e-44; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771237.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057771239.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057771239.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057771239.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057771239.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17966428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B35,C15,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771237.1

214 aa

107

214

LRRNT_2

LRR_14

LRR_8

LRR_1

LRR_4

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 24-63 aa PF23598 LRR_14 71-170 aa PF13855 LRR_8 114-174 aa PF00560 LRR_1 115-137 aa PF12799 LRR_4 115-150 aa PF00560 LRR_1 139-161 aa PF00560 LRR_1 163-181 aa

XP_057771239.1

175 aa

175

LRR_8

LRR_1

LRR_4

LRR_1

PF13855 LRR_8 75-135 aa PF00560 LRR_1 76-98 aa PF12799 LRR_4 76-111 aa PF00560 LRR_1 100-122 aa PF00560 LRR_1 124-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771237.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	24	63	2.2e-12	47.8	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057771237.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	71	170	3.8e-11	43.1	Leucine-rich repeat region
`XP_057771237.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	114	174	1.1e-08	35.4	Leucine rich repeat
`XP_057771237.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	115	137	2.8e-18	62.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057771237.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	115	150	2.1e-12	47.6	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057771237.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	139	161	2.8e-18	62.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057771237.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	163	181	2.8e-18	62.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057771239.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	75	135	3.4e-07	30.6	Leucine rich repeat
`XP_057771239.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	76	98	2e-13	48.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057771239.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	76	111	4.5e-11	43.3	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057771239.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	100	122	2e-13	48.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057771239.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	124	142	2e-13	48.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915254.1
CTCCCTTTTATTGGCTCTATAAATTCCCCAACATGGATTAAGATTCCCTGCCCTTATATTCCTTTCTTTCTTCCTAACATAAAAACATAATAACACACCAATCTTTTTCTGAAAAATTGAAGAATTCATGGCGCTGAGGATTCCTCTCCATCTCCATCTACTGCTCCTAATTCATTTAATAGCACCCATATATGCAAATTTAGAAGGAGATGCTCTTTATGCATTGAGGAGGGCTGTGAATGACCCAGAAAATGTTTTAC...

XM_057915256.1
AATTAGGAGATGCTCTTTATGCATTGAGGAGGGCTGTGAATGACCCAGAAAATGTTTTACAAAGCTGGGATCCTACCTTGGTGGACCCCTGCACTTGGTTTCATGTCACTTGTGATGCTCAAAATAGAGTCACTAGGCTTGATCTTGGAAATGCAAAGCTCTCAGGGAAGCTTGTTCCTGAGTTGGGGAAGCTCCAGAGGCTCCAGTATCTTGTACATGAACAAGTTGATGGGGCCCATTCCAGCTGAACTGGGACAATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991171
ATGGCGCTGAGGATTCCTCTCCATCTCCATCTACTGCTCCTAATTCATTTAATAGCACCCATATATGCAAATTTAGAAGGAGATGCTCTTTATGCATTGAGGAGGGCTGTGAATGACCCAGAAAATGTTTTACAAAGCTGGGATCCTACCTTGGTGGACCCCTGCACTTGGTTTCATGTCACTTGTGATGCTCAAAATAGAGTCACTAGGCTTGATCTTGGAAATGCAAAGCTCTCAGGGAAGCTTGTTCCTGAGTTGGG...

LOC130991171
ATGACCCAGAAAATGTTTTACAAAGCTGGGATCCTACCTTGGTGGACCCCTGCACTTGGTTTCATGTCACTTGTGATGCTCAAAATAGAGTCACTAGGCTTGATCTTGGAAATGCAAAGCTCTCAGGGAAGCTTGTTCCTGAGTTGGGGAAGCTCCAGAGGCTCCAGTATCTTGTACATGAACAAGTTGATGGGGCCCATTCCAGCTGAACTGGGACAATTGAGGAGTCTGGTGAGCCTTGATTTATACCACAATAACCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771237.1
MALRIPLHLHLLLLIHLIAPIYANLEGDALYALRRAVNDPENVLQSWDPTLVDPCTWFHVTCDAQNRVTRLDLGNAKLSGKLVPELGKLQRLQYLEVYMNKLMGPIPAELGQLRSLVSLDLYHNNLTASIPPSLSNLSNLKFLRLNGNRLTGRIPRDLTKLANLKILDVSNNDLCGTIPTSGSFSKLTEESFMNNSRLEGPELMGFVKYDVGGC

XP_057771239.1
MTQKMFYKAGILPWWTPALGFMSLVMLKIESLGLILEMQSSQGSLFLSWGSSRGSSILYMNKLMGPIPAELGQLRSLVSLDLYHNNLTASIPPSLSNLSNLKFLRLNGNRLTGRIPRDLTKLANLKILDVSNNDLCGTIPTSGSFSKLTEESFMNNSRLEGPELMGFVKYDVGGC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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