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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002017`

染色体: Chr07 坐标: 18024925-18026723 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002017`
名称	SmilChr07G002017
描述	GSH-induced LITAF domain protein-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	18024925 - 18026723 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991174`
GeneID	`130991174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991174`
原始查询	`SmilChr07G002017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GSH-induced LITAF domain protein-like
产物	GSH-induced LITAF domain protein-like
Arabidopsis	`AT5G13190` (GILP) GSH-induced LITAF domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831158] identity=66; qcov=0.973; evalue=1.32e-65; confidence=high
Rice	`Os02g0515600` - identity=64.1; qcov=0.959; evalue=8.83e-65; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10601 (zf-LITAF-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771243.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057771242.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771243.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057771242.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771243.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:18025987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771242.1

154 aa

154

zf-LITAF-like

PF10601 zf-LITAF-like 60-122 aa

XP_057771243.1

148 aa

148

zf-LITAF-like

PF10601 zf-LITAF-like 60-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771242.1`	Pfam	`PF10601`	zf-LITAF-like	Family	60	122	2.8e-13	50.5	LITAF-like zinc ribbon domain
`XP_057771243.1`	Pfam	`PF10601`	zf-LITAF-like	Family	60	124	3.3e-14	53.5	LITAF-like zinc ribbon domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915260.1
TGGCGTGCCGGACCGAGCCGGTACGCGGCGAATCGGTTGGCTCGTGCTGGACTCGATTCTTGGTATCGGGCACGAAGTCGAGAAAGGCGCTTCGCGTGTATATCTTTCAATTTAAAAAAAAAAAAATGACGTGCGAAAATCCGACTGAAACATTGTTGCTATGAGAAGGATGGATCCTTGCTGATTTATTCTGGTTGCTGCTACAAAGAATGGGGCGGCAATGGTGGGGTTTGACCGAACTACATTATGGAATGAAGACT...

XM_057915259.1
GACTGAAACATTGTTGCTATGAGAAGGATGGATCCTTGCTGATTTATTCTGGTTGCTGCTACAAAGAATGGGGCGGCAATGGTGGGGTTTGACCGAACTACATTATGGAATGAAGACTTGGAGATGCAGTCAACTTCTTCTTTCTAGAAGCCAATCCCAATATTTCAAAGTTTCAAAGTTCAAACCCCTATCTATAGTCTATTACTCTTCCATCTTCTTCTTATTTTTTCAAACCCTATTACTATTCTCCCAATTCTCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991174
ATGGAAAAAACGGCCAAGACCGACGAGCCAGCGATTGGGATTCCGTACAATGCGGCGTATCAGGCGCCAATGCCGCAGCGGTTTTACGTAGAAAACCCTTATCAAGCTGGCACCATCCCTCCAAATGCCATTGTTGGAGACCCCAAAGGAATTCCCCTTCAACAGACTATTTACCGTGACACCCCTGCGCCCTTCAATTGCCCCTACTGCGGCGGCACCGGCATCACCACCGTCAAGTCTAAACCAAGTTTAGCTGCAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771242.1
MEKTAKTDEPAIGIPYNAAYQAPMPQRFYVENPYQAGTIPPNAIVGDPKGIPLQQTIYRDTPAPFNCPYCGGTGITTVKSKPSLAAVVGCMMPFMLGVCFLCPSMDCLWHKYHYCPSCNEKVKLVTFLYVLHEYMPIFGTNIEKILFFVSLLDC

XP_057771243.1
MEKTAKTDEPAIGIPYNAAYQAPMPQRFYVENPYQAGTIPPNAIVGDPKGIPLQQTIYRDTPAPFNCPYCGGTGITTVKSKPSLAAVVGCMMPFMLGVCFLCPSMDCLWHKYHYCPSCNEKIADFEKSDICSVMDPPHYIQESFALPA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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