当前解析结果
SmilChr07G002021| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002021 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002021 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002021 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 18155188 - 18157790 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991179 |
|---|---|
| GeneID | 130991179 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991179 |
| 原始查询 | SmilChr07G002021 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839634]; symbol=AT1G27435; hit=AT1G27435; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839634]; symbol=AT1G27435; hit=AT1G27435; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G27435 (AT1G27435)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839634] identity=66.2; qcov=0.727; evalue=3.53e-29; confidence=medium |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991179 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057771246.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057771246.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057771246.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057771246.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771246.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:18155466 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A25,B39,C13,C69,C86 |
Chr7:18155520 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B13,C23,C28 |
Chr7:18157590 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,C2 |
Chr7:18157720 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B81 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。