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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002037`

染色体: Chr07 坐标: 18473101-18474273 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002037`
名称	SmilChr07G002037
描述	uncharacterized SmilChr07G002037
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	18473101 - 18474273 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993118`
GeneID	`130993118`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993118`
原始查询	`SmilChr07G002037`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824041]; symbol=AT3G48800; hit=AT3G48800; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824041]; symbol=AT3G48800; hit=AT3G48800; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G48800` (AT3G48800) Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824041] identity=40.2; qcov=0.932; evalue=8.37e-40; confidence=medium
Rice	`Os03g0850300` - identity=77.4; qcov=0.209; evalue=4.9e-27; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00536 (SAM_1); PF07647 (SAM_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993118

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773854.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773854.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773854.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773854.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773854.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:18473321`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr7:18473321`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B110
`Chr7:18473606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B52,B86,D3
`Chr7:18473648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B52,B86,D3
`Chr7:18473705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B34,C3
`Chr7:18473800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,B78,B82
`Chr7:18473813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr7:18473865`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B12
`Chr7:18473865`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B12
`Chr7:18473885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B14,B8,C58,C77
`Chr7:18473954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773854.1

296 aa

148

296

SAM_1

SAM_2

PF00536 SAM_1 236-292 aa PF07647 SAM_2 236-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773854.1`	Pfam	`PF00536`	SAM_1	Domain	236	292	7.1e-13	49.4	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057773854.1`	Pfam	`PF07647`	SAM_2	Domain	236	292	1.3e-12	48.4	SAM domain (Sterile alpha motif)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917871.1
GCCTTTGGTTATTAAATGTGTCTGTGAAAAGGTTTTGGGCCGAAAAATAGAAGGCCGCTCTCAACAATCCATCTCCACCTTCTCCTCTCCTTCTCCTCATCTCACGCTCACTAAATTATACTCACTCCACTCTCTCTCTCTCACACACACACATGGCAACAGAGCATCAACAGCCGGACGCCCAAATCTCCCCCGCCCCGCCCCCCGCCAACACCACCACCGCCCCCCCCGCAGACCCCCCTCCTCTCGACAATCCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993118
ATGGCAACAGAGCATCAACAGCCGGACGCCCAAATCTCCCCCGCCCCGCCCCCCGCCAACACCACCACCGCCCCCCCCGCAGACCCCCCTCCTCTCGACAATCCCACCACCACCGCCACCCCCGCCGCCAACCCTCCCAAGCGACAGCGCCGCCCCAGCGTCCGCCTCGGCGAGATCGGAGGCGACCCACCCTACGATGTTCCCCAGCGACGCCCCAATAAAACCTGGCGCTTCCACAAAGACCCATCTTTAGCCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773854.1
MATEHQQPDAQISPAPPPANTTTAPPADPPPLDNPTTTATPAANPPKRQRRPSVRLGEIGGDPPYDVPQRRPNKTWRFHKDPSLAAKTSKTRPLTNLVNGAAPVAAAADSNFQDSVELSENYADFGLRKSKVKKPTKRARTNWNKFDSSAVNNGVIESTSFLQEENDNNNEEFRELEGEGSESPKQQSPINSAENMGLQFWDQQRRGSRARVSEINGVHLNEVNSPEKNNEGNLGVREWLIGLGLGRYAPVFEIHEVDDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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