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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002038`

染色体: Chr07 坐标: 18484043-18491416 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002038`
名称	SmilChr07G002038
描述	coiled-coil domain-containing protein SCD2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	18484043 - 18491416 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993119`
GeneID	`130993119`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993119`
原始查询	`SmilChr07G002038`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coiled-coil domain-containing protein SCD2
产物	coiled-coil domain-containing protein SCD2
Arabidopsis	`AT5G13260` (AT5G13260) myosin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831167] identity=57.9; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0928100` - identity=59.1; qcov=0.863; evalue=1.16e-177; confidence=high
GO	GO:0000911 (cytokinesis by cell plate formation)
KEGG	-
Pfam	PF27823 (SCD2_helical_N); PF30610 (SCD2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993119

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057773855.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057773855.1`
3	Phragmoplast	Phragmoplast	0.20000	`XP_057773855.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057773855.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773855.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:18484356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:18484362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B8,C58
`Chr7:18486607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:18487649`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr7:18487649`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr7:18491248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773855.1

553 aa

276

553

SCD2_helical_N

SCD2_C

PF27823 SCD2_helical_N 199-281 aa PF30610 SCD2_C 322-535 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773855.1`	Pfam	`PF27823`	SCD2_helical_N	Domain	199	281	6.1e-34	116.8	SCD2 N-terminal domain
`XP_057773855.1`	Pfam	`PF30610`	SCD2_C	Domain	322	535	1e-91	307.2	SCD2, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917872.1
AACAAAATTGAGTAAATCCTCAAATTATGATGTTATTAACGTGATTAGTGACGTAGTATTTGTTAAACAAGGGGGCGCCATACAAAATCATATCAGAAATGGCCATAAATTTCTCCGACACCCAAAAAACACGGCCATTTTTTGAGTCGAAGATCTAGGCACTAACGGCAGCACTCTCCCCTCTCTCACATCTATGCTCAACTCGCATTTCCTCTTTTGATTCAACCTTTACAGCAACACAAATGGAGAAGATGCGCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993119
ATGGAGAAGATGCGCCAGTGGGGCAGCGAGTCCGGCGGAGCGTCGCCGGCGCGTGGGCACCACGCTCGCTCGTCGTCCGCCAGCGGCATTTCGAGCATCAAGCGCACTCAGAACTACGCCGCCAAAGCCGCGGCGCAGCGGCTGGCTCAGGTCATGGCCTCGCAAGCCGCCGCCACCGACGACGAGGATGAGGACGACGCTGGCGTCGGAGACAATGATGGTGATTTCGGACTCCGATTCAATCCTCCTCTTCCGCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773855.1
MEKMRQWGSESGGASPARGHHARSSSASGISSIKRTQNYAAKAAAQRLAQVMASQAAATDDEDEDDAGVGDNDGDFGLRFNPPLPLSLSRPPVKTNGASNGSGGVKPLLPSPKIIRSSSDAVTCDLLEVQPARSTSTGRPSMSTRTMPAVPPSRPSVKTPAPFPPIDPPSSRQREKKFSPDLGQLNLRDTGDGRASSALRDELDMLQEENENIIEKLKLAEESCEAAESRVKELEKQVAALGEGVSLEAKLLSRKEAALR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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