当前解析结果
SmilChr07G002040| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002040 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002040 |
| 描述 | protein NEOXANTHIN-DEFICIENT 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 18511461 - 18515433 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993123 |
|---|---|
| GeneID | 130993123 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993123 |
| 原始查询 | SmilChr07G002040 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein NEOXANTHIN-DEFICIENT 1 |
| 产物 | protein NEOXANTHIN-DEFICIENT 1 |
| Arabidopsis | AT1G28100 (AT1G28100)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839703] identity=60.9; qcov=1; evalue=8.23e-99; confidence=high |
| Rice | Os10g0499600- identity=82.4; qcov=0.416; evalue=4.8e-52; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993123 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.80000 | XP_057773867.1 |
| 2 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.40000 | XP_057773867.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057773859.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057773859.1 |
| 5 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057773859.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:18511573 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr7:18511575 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C63,C87 |
Chr7:18511717 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr7:18512039 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C14,C19,C73 |
Chr7:18512218 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
9 records
下载 cDNA FASTA9 records
下载 CDS FASTA9 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。