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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002054`

染色体: Chr07 坐标: 18647059-18651061 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002054`
名称	SmilChr07G002054
描述	OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	18647059 - 18651061 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993135`
GeneID	`130993135`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993135`
原始查询	`SmilChr07G002054`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 1
产物	OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 1
Arabidopsis	`AT1G28120` (AT1G28120) ubiquitin thioesterase otubain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839705] identity=67; qcov=1; evalue=5.46e-149; confidence=high
Rice	`Os08g0537800` (WTG1) - identity=69.8; qcov=0.865; evalue=1.11e-139; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0071108 (protein K48-linked deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF10275 (Peptidase_C65)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993135

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773890.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057773890.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057773890.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773890.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773890.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:18647297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,C35,C40,C81
`Chr7:18647306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B45,C46,C70,C83
`Chr7:18647834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:18648860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B45,C46,C70,C83
`Chr7:18649908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773890.1

303 aa

152

303

Peptidase_C65

PF10275 Peptidase_C65 47-302 aa

XP_057773891.1

303 aa

152

303

Peptidase_C65

PF10275 Peptidase_C65 47-302 aa

XP_057773892.1

303 aa

152

303

Peptidase_C65

PF10275 Peptidase_C65 47-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773890.1`	Pfam	`PF10275`	Peptidase_C65	Family	47	302	1.9e-88	296.8	Peptidase C65 Otubain
`XP_057773891.1`	Pfam	`PF10275`	Peptidase_C65	Family	47	302	1.9e-88	296.8	Peptidase C65 Otubain
`XP_057773892.1`	Pfam	`PF10275`	Peptidase_C65	Family	47	302	1.9e-88	296.8	Peptidase C65 Otubain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917908.1
ATCCATAATAATTAAGCACGGTTGGATAAAACTAGAGTAATAATAAAAAAGAAAAGTGAAGCAGGCCCCCTCCCCTCCCTACCTCTTTCGCCCATCACTCTTAGTTGAAGAAGTGAGAGAAACTACGCAGATCAACTTTCTCTTTCTAAGGAGATCCACTTCTTCTATTCGGGGTACAGGCTGTTTTCTGGTCATAAAACCTCAAGACCTGCCTGCTACCGTATTTCTATCTGAATTGTTGAGGAAAGTAAATTTGCCAA...

XM_057917909.1
GGTGCGCCCTCTCCCTATTCCTCCTTCATTTATTTACACACATGAATTTGGCTACTCTTATTTGTTCAAATTCTTCACTATAATCCGTCTTTGTCTACAGAATTTATTGTTCAGTGTTTGGGTACAGGCTGTTTTCTGGTCATAAAACCTCAAGACCTGCCTGCTACCGTATTTCTATCTGAATTGTTGAGGAAAGTAAATTTGCCAACCGTTAAAGATGCAGAATCAGGATGGGCAAGCTGTGGAACCTGAAACGGAGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130993135
ATGCAGAATCAGGATGGGCAAGCTGTGGAACCTGAAACGGAGACCGTAACATCATTGCCAACCTCTGAGACCAATGACTGGGCAAATTATAGGGATGATGAGGTTATGCAGCAGCATTCCGCCATACAGGCAGAGGAAGCTGGGAAAATCCCATTTGTTGGTGACAAGGAGCCTCTCTCATCTTTAGCAGATGAATACAAGTCAGGAAACCCAATTTTGTTGGAGAAAATTAAGGTTCTGACCGAACAGTATGCTGCCAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057773890.1
MQNQDGQAVEPETETVTSLPTSETNDWANYRDDEVMQQHSAIQAEEAGKIPFVGDKEPLSSLADEYKSGNPILLEKIKVLTEQYAAIRRTRGDGNCFFRSFMFAYLEHILESQDRTEIDRIAVNVEQCRKTLLSLGYAEFTFEDFFALFLEQLESVLSGKEACISHEELLQRSRDQSVSDYVVMFFRFITSGEIRKRSEFYEPFIQGLTNTSVEQFCKSSVEPMGEESDHVHITALSDALGVPIRIVYLDRSHDDKGSVS...

XP_057773891.1
MQNQDGQAVEPETETVTSLPTSETNDWANYRDDEVMQQHSAIQAEEAGKIPFVGDKEPLSSLADEYKSGNPILLEKIKVLTEQYAAIRRTRGDGNCFFRSFMFAYLEHILESQDRTEIDRIAVNVEQCRKTLLSLGYAEFTFEDFFALFLEQLESVLSGKEACISHEELLQRSRDQSVSDYVVMFFRFITSGEIRKRSEFYEPFIQGLTNTSVEQFCKSSVEPMGEESDHVHITALSDALGVPIRIVYLDRSHDDKGSVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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