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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002061`

染色体: Chr07 坐标: 18748648-18749553 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002061`
名称	SmilChr07G002061
描述	probable disease resistance protein RF9
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	18748648 - 18749553 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993928`
GeneID	`130993928`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993928`
原始查询	`SmilChr07G002061`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein RF9
产物	probable disease resistance protein RF9
Arabidopsis	`AT1G59218` (AT1G59218) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842234] identity=34.6; qcov=0.787; evalue=1.27e-27; confidence=low
Rice	`Os10g0162846` - identity=25.9; qcov=0.884; evalue=7.78e-14; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993928

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774948.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057774948.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774948.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057774948.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774948.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:18748649`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B137,B81,C15
`Chr7:18748649`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B137,B81,C15
`Chr7:18748654`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B81,C15
`Chr7:18748654`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B81,C15
`Chr7:18748655`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B81,C15
`Chr7:18748655`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B81,C15
`Chr7:18748670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B87,C82
`Chr7:18748675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C15,C6
`Chr7:18748676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B87,C82
`Chr7:18748684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B87,C82
`Chr7:18748701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B81,C27,C6,C61
`Chr7:18748707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B81,C27,C6,C61,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774948.1

301 aa

150

301

LRR_14

PF23598 LRR_14 2-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774948.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	2	232	1.4e-11	44.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918965.1
ATGGACACCCTTGATTTAAGTCGTTCGGGGAATGTTGAAGTACCAAATGTTTTCAAAGAGATGCTACGTTTAAAACACTTGTCTCTTCCCGATTATGAGAAGGAAAATATTGGAAGTTATCGATTAACATTGGATGAGGGAGTGATTGAGTTGGAAAGCCTATGGCAGTTGGATAGTAGAGTGCATGAATTAAAATGTATGAACAAAATGAAGGATCTTCGGCGTTTTGGAGCACGCATGCACGACAATGAAAGCTTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993928
ATGGACACCCTTGATTTAAGTCGTTCGGGGAATGTTGAAGTACCAAATGTTTTCAAAGAGATGCTACGTTTAAAACACTTGTCTCTTCCCGATTATGAGAAGGAAAATATTGGAAGTTATCGATTAACATTGGATGAGGGAGTGATTGAGTTGGAAAGCCTATGGCAGTTGGATAGTAGAGTGCATGAATTAAAATGTATGAACAAAATGAAGGATCTTCGGCGTTTTGGAGCACGCATGCACGACAATGAAAGCTTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774948.1
MDTLDLSRSGNVEVPNVFKEMLRLKHLSLPDYEKENIGSYRLTLDEGVIELESLWQLDSRVHELKCMNKMKDLRRFGARMHDNESLSAMIDAIAIMDKLVFCSVEIKEGCELGTNEGVLKKVFTCPNLHFLSIKVNLGKALVECGRDFMSSNLRRLLLSECEIEDDPMEILGKLPCLVELFLFRKSFVGEEMTCPSNSFPRLMKLVLYQLPMLREWKVETRAMPLLSQLQIIECSRLKMIPDGLLHIIECSSLKMIPDGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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