当前解析结果
SmilChr07G002065| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002065 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002065 |
| 描述 | uncharacterized protein At4g14100-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 18774292 - 18776370 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993145 |
|---|---|
| GeneID | 130993145 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993145 |
| 原始查询 | SmilChr07G002065 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transferases, transferring glycosyl groups [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827045]; symbol=AT4G14100; hit=AT4G14100; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | transferases, transferring glycosyl groups [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827045]; symbol=AT4G14100; hit=AT4G14100; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G14100 (AT4G14100)transferases, transferring glycosyl groups [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827045] identity=61.3; qcov=0.877; evalue=1.86e-95; confidence=high |
| Rice | Os07g0189800- identity=55.9; qcov=0.709; evalue=5.6e-60; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF28435 (DUF8395) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993145 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Vacuole | 液泡 | 0.80000 | XP_057773908.1 |
| 2 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057773908.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057773908.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773908.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773908.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:18775801 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B105,C50,C65 |
Chr7:18775916 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:18776084 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B105,C50,C65 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057773908.1PF28435
DUF8395 45-192 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057773908.1 |
Pfam | PF28435 |
DUF8395 | Domain | 45 | 192 | 3.9e-80 | 267.8 | Domain of unknown function (DUF8395) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。