当前解析结果
SmilChr07G002076| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002076 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002076 |
| 描述 | probable protein S-acyltransferase 7 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 18880329 - 18883960 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993158 |
|---|---|
| GeneID | 130993158 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993158 |
| 原始查询 | SmilChr07G002076 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable protein S-acyltransferase 7 |
| 产物 | probable protein S-acyltransferase 7 |
| Arabidopsis | AT3G26935 (AT3G26935)DHHC-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822311] identity=48.7; qcov=1.06; evalue=1.91e-129; confidence=high |
| Rice | Os08g0539100 (P0666G10.108)- identity=58.6; qcov=0.989; evalue=8.07e-152; confidence=high |
| GO | GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006612 (protein targeting to membrane); GO:0018230 (peptidyl-L-cysteine S-palmitoylation); GO:0019706 (protein-cysteine S-palmitoyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01529 (DHHC) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993158 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057773919.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.40000 | XP_057773919.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.40000 | XP_057773919.1 |
| 4 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057773919.1 |
| 5 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057773919.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:18880858 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A8 |
Chr7:18880882 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr7:18880951 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B36,B37,B59,C5 |
Chr7:18881092 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:18881167 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr7:18881172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,B80 |
Chr7:18881771 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr7:18881806 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr7:18882428 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,D1 |
Chr7:18882512 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057773919.1PF01529
DHHC 151-276 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057773919.1 |
Pfam | PF01529 |
DHHC | Family | 151 | 276 | 1.4e-36 | 126.2 | DHHC palmitoyltransferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。