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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002077`

染色体: Chr07 坐标: 18887064-18887669 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002077`
名称	SmilChr07G002077
描述	uncharacterized SmilChr07G002077
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	18887064 - 18887669 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993930`
GeneID	`130993930`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993930`
原始查询	`SmilChr07G002077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834843]; symbol=AT5G47920; hit=AT5G47920; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	transcription elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834843]; symbol=AT5G47920; hit=AT5G47920; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G47920` (AT5G47920) transcription elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834843] identity=42.2; qcov=1.01; evalue=3.29e-40; confidence=medium
Rice	`Os04g0382400` - identity=40.6; qcov=1.06; evalue=1.32e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05553 (DUF761)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993930

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774950.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057774950.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057774950.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774950.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:18887105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:18887236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:18887259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:18887355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:18887368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C52
`Chr7:18887537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B138,B140,B31,D8
`Chr7:18887576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B61
`Chr7:18887662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B13,B26,B77,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774950.1

201 aa

100

201

DUF761

PF05553 DUF761 164-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774950.1`	Pfam	`PF05553`	DUF761	Family	164	199	1.6e-14	53.9	Cotton fibre expressed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918967.1
ATGAAGGAGAAAGGTTCGAGGCTGAAGCAGCTGATATCAATGGTGACTTGCATGACCAGAGCCAAATGCATGGCGGTCAGGAGCAAAACCGACGCCGTCAGAGCGCGCCTCATGCTCACATCGCTCACGCTTCTCTCCAAGAAGAAGAGCTTCTCCATCGCCGCCATCTCCGCCAAGATCAACGACATTTTCCACCACCACCACGCCGCCGATGACGACGACGACGATGAGCCGAGCAAGGCGATCGTCCTCTACAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993930
ATGAAGGAGAAAGGTTCGAGGCTGAAGCAGCTGATATCAATGGTGACTTGCATGACCAGAGCCAAATGCATGGCGGTCAGGAGCAAAACCGACGCCGTCAGAGCGCGCCTCATGCTCACATCGCTCACGCTTCTCTCCAAGAAGAAGAGCTTCTCCATCGCCGCCATCTCCGCCAAGATCAACGACATTTTCCACCACCACCACGCCGCCGATGACGACGACGACGATGAGCCGAGCAAGGCGATCGTCCTCTACAGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774950.1
MKEKGSRLKQLISMVTCMTRAKCMAVRSKTDAVRARLMLTSLTLLSKKKSFSIAAISAKINDIFHHHHAADDDDDDEPSKAIVLYSSKSAASCCKIGGGSEAIGSVLEFDDGDDDDKYPDLRHSLFEEEEEQELAELLDDPNSSISAIDLVKNSKESGESFNLEDDIDQVADLFITKFHKRMRLQKLLSFKRHQQMLERSA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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