当前解析结果
SmilChr07G002085| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002085 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002085 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002085 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 18970801 - 18971935 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993931 |
|---|---|
| GeneID | 130993931 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993931 |
| 原始查询 | SmilChr07G002085 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993931 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057774951.1 |
| 2 | Nuclear body | 核内小体 | 0.80000 | XP_057774951.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057774951.1 |
| 4 | PML body | PML body | 0.60000 | XP_057774951.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774951.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:18971311 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B138 |
Chr7:18971326 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C78 |
Chr7:18971387 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B127 |
Chr7:18971396 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B36,B83 |
Chr7:18971396 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B36,B83 |
Chr7:18971404 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr7:18971411 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B3,B48,C5 |
Chr7:18971435 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,B129,C18 |
Chr7:18971636 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B11,B66,C44,C55 |
Chr7:18971666 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B42,B89,C26,C5,C78 |
Chr7:18971668 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B44,C80 |
Chr7:18971674 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B34,B80,C13,C62 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。