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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002100`

染色体: Chr07 坐标: 19107220-19109037 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002100`
名称	SmilChr07G002100
描述	uncharacterized SmilChr07G002100
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19107220 - 19109037 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993179`
GeneID	`130993179`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993179`
原始查询	`SmilChr07G002100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G02550` (AT4G02550) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827910] identity=28.2; qcov=0.494; evalue=6.67e-06; confidence=low
Rice	`Os04g0590366` - identity=30.3; qcov=0.481; evalue=7.84e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993179

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773941.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773941.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773941.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773941.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773941.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19107443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr7:19107446`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B14,B90,B92,C14
`Chr7:19107446`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B14,B90,B92,C14
`Chr7:19107795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr7:19107827`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,C10
`Chr7:19107827`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B41,C10
`Chr7:19107869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr7:19107950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B6,B63,C79,D11
`Chr7:19107968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr7:19108002`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A14,A2,A7,B103,B108,B110,B132,B15,B19,B40,B48,B65,B80,B94,C2,C28,C37,C5,C54,C64,C67,C69,C8,D7
`Chr7:19108009`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A14,A2,A7,B103,B108,B110,B132,B15,B19,B40,B48,B65,B80,B94,C2,C20,C28,C5,C60,C64,C67,C69,C8,D7
`Chr7:19108010`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A14,A2,A7,B103,B108,B110,B132,B15,B19,B40,B48,B65,B80,B94,C2,C20,C28,C5,C60,C64,C67,C69,C8,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773941.1

316 aa

158

316

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 27-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773941.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	27	123	2.5e-05	25.9	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917958.1
TGGGGGAAAATGAAATAGAAGCGCCATTTTACCTTCATTTTAGGGCGCGAATTCGAAACTGATAAAAGCAGCGAAATTCCTCACAGAATCATTGCTGTTCCTATTGCTAAACGAGAATTAATCCTTGGAGAATCTCTATTTCACTGGGAGTTGAAAGATTTTTTCATTTCGATATCGTGTTCTTGCTCCGACGCTATAAACAGTAAACACCATGAGTACCTTCCATCAAGACTCGGCGAGTAATGAAATCGGACCTGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993179
ATGAGTACCTTCCATCAAGACTCGGCGAGTAATGAAATCGGACCTGAAAAGTCCATGAAACCTGGAAAGACACGACGTAGTTGGTCAGTGAGGGAGGAGGAGGTGCTTCTTGCTGCTTTGAAGGAACTTGTAGTGCAGGGTTGGAAGTCGGACAATGGATTCAAAGCTGGGTATCTTGGAAAGCTTCAAGAAGCTGTTAAGAATGCGTTTCCAGGGACGGATCTCAGGGGCACGCCTCATATCCATTCAAAAATACAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773941.1
MSTFHQDSASNEIGPEKSMKPGKTRRSWSVREEEVLLAALKELVVQGWKSDNGFKAGYLGKLQEAVKNAFPGTDLRGTPHIHSKIQTWKKNYASLSYMLTKTGVGFNVDGKYMIDCDTELWNEIVKCDPNASNMRKKSWLYLEEWKEIFGKDRANGTSAEDVVDALHEMNDEDNLDNEGTQGDYHPHFEDEAENEVADDSVCQPQRNSAAAKVLGKKRKANDDSFGQLIEVLGEMSKNADKRADTIAGRIGYEQDLGKAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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