当前解析结果
SmilChr07G002104| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002104 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002104 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002104 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 19129293 - 19134199 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993183 |
|---|---|
| GeneID | 130993183 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993183 |
| 原始查询 | SmilChr07G002104 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase-like protein (DUF1624) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834841]; symbol=AT5G47900; hit=AT5G47900; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase-like protein (DUF1624) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834841]; symbol=AT5G47900; hit=AT5G47900; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G47900 (AT5G47900)heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase-like protein (DUF1624) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834841] identity=65; qcov=0.858; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0526000- identity=60.1; qcov=0.839; evalue=0; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07786 (HGSNAT_cat) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993183 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057773945.1 |
| 2 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.40000 | XP_057773945.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057773945.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057773945.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057773945.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:19129861 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C15,C21 |
Chr7:19130056 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B19 |
Chr7:19130155 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,B78 |
Chr7:19130800 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B33,B59,C5,C72 |
Chr7:19132693 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057773945.1PF07786
HGSNAT_cat 72-196 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057773945.1 |
Pfam | PF07786 |
HGSNAT_cat | Domain | 72 | 196 | 1.7e-06 | 28.4 | Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase, catalytic |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。