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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002107`

染色体: Chr07 坐标: 19196031-19197938 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002107`
名称	SmilChr07G002107
描述	probable glycosyltransferase At5g03795
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19196031 - 19197938 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993189`
GeneID	`130993189`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993189`
原始查询	`SmilChr07G002107`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glycosyltransferase At5g03795
产物	probable glycosyltransferase At5g03795
Arabidopsis	`AT4G38040` (AT4G38040) Exostosin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829960] identity=32.9; qcov=0.764; evalue=1.08e-29; confidence=low
Rice	`Os02g0187200` - identity=32.6; qcov=0.856; evalue=4.31e-30; confidence=low
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993189

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057773951.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773951.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773951.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773951.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773951.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19196463`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A3,B65
`Chr7:19196463`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A3,B65
`Chr7:19196466`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A3,B65
`Chr7:19196466`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A3,B65
`Chr7:19196474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B28,B53,B68,C46,C73,D6
`Chr7:19196483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C24,C9
`Chr7:19196485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B65
`Chr7:19196511`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B110,B125,B131,B40,B54,B87,C41,C44,C46,D9
`Chr7:19196515`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	210	A1,A10,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B12,B120,B121,B123,B125,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B65,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B82,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B97,B98,B99,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D5,D6,D8,D9
`Chr7:19196521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B74
`Chr7:19196527`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B92,C21
`Chr7:19196527`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B92,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773951.1

403 aa

202

403

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 69-351 aa

XP_057773952.1

434 aa

217

434

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 100-382 aa

XP_057773953.1

326 aa

163

326

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 100-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773951.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	69	351	3e-54	185.1	Exostosin GT47 domain
`XP_057773952.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	100	382	3.6e-54	184.8	Exostosin GT47 domain
`XP_057773953.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	100	326	3.1e-29	103.0	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917968.1
AATAGTAGTGCCGTTGAAGAAGCAAGAATTTACAGTATTTTATTTTTAGAAGAACCAAGAATGTTTACTAGTACTACATATAAAAAGTGGAGTGACACGCAAACCGAGGGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTCTTCCACCACCGGAAGGAAGTTCCTCCGCCGCCATTAGCTGTAACTTAGAGAAAGAGGGCGTGATGAGTCTGCGCAGTATCTCAAGGCGAAAATGTTGGAATGCATATCTCATGATGTTCT...

XM_057917969.1
AAAGTGGAGTGACACGCAAACCGAGGGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTCTTCCACCACCGGAAGGAAGTTCCTCCGCCGCCATTAGCTGTAACTTGTAAGTGCTGACTGCTGCTTCACCTCTCTTTCCTTTTCATGTCCACCTCAGGAATTAAATGCTCCCAGATTGGTACACTTAAATTCTTTGTGACTTAAGGGAACATTTACATTTGATCCTCGATTTTCTTCTTGAATTTATGTTTTTGATTTTTGAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130993189
ATGAAAAGTCTGAGTCATCATCGTCGACTTTGTCTCACTTCAAACTTACTAGTAGTATTTGTTTACTTTATGATTAGAGAGAAAGAGGGCGTGATGAGTCTGCGCAGTATCTCAAGGCGAAAATGTTGGAATGCATATCTCATGATGTTCTCACCCATCGCTCTCCTCTTGATCACATCTTCATCCATTTGGTCGCTGCGCCCTCAAATTCCCGACCTCAAGTCGTCTCCTCCGCCTCCGAGGAGCTCTCCTTATCACGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057773951.1
MSLRSISRRKCWNAYLMMFSPIALLLITSSSIWSLRPQIPDLKSSPPPPRSSPYHDWEFFNADYEEMLSKLRIYVYPDALNANTSSSAVFLPHPDPLNPKIGNYYSEHAFKLALLRSSLVTQRPNHAHFFFMPFSINMMRYHPLLRSESSISTFVANYVTKISSQSAHWNASGGADHFFVCCHSVGREATSQHSALRNNAIQITCSSSYFQRLYTPHRDIALPQVWPRPDHQTLIPPHQRSKHVFFAGRAQNSVARQEVL...

XP_057773952.1
MKSLSHHRRLCLTSNLLVVFVYFMIREKEGVMSLRSISRRKCWNAYLMMFSPIALLLITSSSIWSLRPQIPDLKSSPPPPRSSPYHDWEFFNADYEEMLSKLRIYVYPDALNANTSSSAVFLPHPDPLNPKIGNYYSEHAFKLALLRSSLVTQRPNHAHFFFMPFSINMMRYHPLLRSESSISTFVANYVTKISSQSAHWNASGGADHFFVCCHSVGREATSQHSALRNNAIQITCSSSYFQRLYTPHRDIALPQVWPRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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