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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002108`

染色体: Chr07 坐标: 19197946-19201111 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002108`
名称	SmilChr07G002108
描述	uncharacterized SmilChr07G002108
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19197946 - 19201111 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993190`
GeneID	`130993190`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993190`
原始查询	`SmilChr07G002108`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	classical AGP protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831040]; symbol=AT5G11680; hit=AT5G11680; species=arabidopsis; confidence=high
产物	classical AGP protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831040]; symbol=AT5G11680; hit=AT5G11680; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G11680` (AT5G11680) classical AGP protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831040] identity=78.3; qcov=1.02; evalue=4.9e-118; confidence=high
Rice	`Os09g0512900` (P0450E05.3-1) - identity=76.4; qcov=0.985; evalue=1.19e-109; confidence=high
GO	GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0031490 (chromatin DNA binding); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993190

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773955.1`
2	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057773955.1`
3	Endosome	内体	1.00000	`XP_057773955.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057773955.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057773955.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19198334`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C18
`Chr7:19198334`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C18
`Chr7:19198370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr7:19199674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917972.1
AGCGTAGTCGGTTGGGTTATCTGTTATTGGGCCATCTTTAACAATTAATTTAATTAAAGCCCAAAAGGAGATGTTACATATTCTTTCTACAAATTCGAGAATATGGTAGTAGTTTGCGACGCCCACGCGTTTTATAGTTAGAGATCATCGCGTATTTGCGTACTCAAAAATTCTTCATAATCTACCCTGCACCCAAAGCTCTTGGAGTTGAATCTAGATACAGAAAGCATGGCTCTGAATCCTCAACTCTTCCCCAATGG...

XM_057917971.1
TTCTACAAATTCGAGAATATGGTAGTAGTTTGCGACGCCCACGCGTTTTATAGTTAGAGATCATCGCGTATTTGCGTACTCAAAAATTCTTCATAATCTACCCTGCACCCAAAGCTCTTGGAGTTGAATCTAGATACAGAAAGCATGGCTCTGAATCCTCAACTCTTCCCCAATGGGATGCCGGTGCCCTTCATCAACGAGATGTTCGTCTTGGCTAGAGACGGCGTCGAATTTGAGATCGACAAGATCCCCGGCACTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993190
ATGGCTCTGAATCCTCAACTCTTCCCCAATGGGATGCCGGTGCCCTTCATCAACGAGATGTTCGTCTTGGCTAGAGACGGCGTCGAATTTGAGATCGACAAGATCCCCGGCACTCAAGGTGGAACAGTTAAAGCAAAAGGAACTATTTACTTGTCAAATATCCGCATGGTGTTCGTTGCAAAGAAACCTGTTGGGAATCTTTTTGCTTTTGATATGCCCCTGCTCCATGTTCATGATGAGAAATTCCACCAGCCAATTTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773954.1
MALNPQLFPNGMPVPFINEMFVLARDGVEFEIDKIPGTQGGTVKAKGTIYLSNIRMVFVAKKPVGNLFAFDMPLLHVHDEKFHQPIFYCNNIAGRVEPVVPDNEHRALYSTHSFKILFKDGGCGTFVPLFFNLISSVRQYNQHLAAQPRVDPLQAAQTPVDEMMRHAYVFFLLHTIAVFAVFTSCSANERRNCMYVADTLILATLLEFSCSSQTQSHS

XP_057773955.1
MALNPQLFPNGMPVPFINEMFVLARDGVEFEIDKIPGTQGGTVKAKGTIYLSNIRMVFVAKKPVGNLFAFDMPLLHVHDEKFHQPIFYCNNIAGRVEPVVPDNEHRALYSTHSFKILFKDGGCGTFVPLFFNLISSVRQYNQHLAAQPRVDPLQAAQTPVDEMMRHAYVDPSDPTRIFLQQPNAESQLRRRTYQPNNTENPM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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