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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002114`

染色体: Chr07 坐标: 19255790-19262603 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002114`
名称	SmilChr07G002114
描述	uncharacterized SmilChr07G002114
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19255790 - 19262603 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993196`
GeneID	`130993196`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993196`
原始查询	`SmilChr07G002114`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821527]; symbol=AT3G19895; hit=AT3G19895; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821527]; symbol=AT3G19895; hit=AT3G19895; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G19895` (AT3G19895) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821527] identity=62.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0829600` (OJ1124_D06.12-1) - identity=57.9; qcov=0.888; evalue=3.35e-143; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23112 (PUB62-63_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993196

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773964.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773964.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057773964.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773964.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773964.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19256047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B95,C29,C54
`Chr7:19256076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr7:19256154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:19256200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,C12,C27,C6,D10
`Chr7:19256205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B64
`Chr7:19257586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C37
`Chr7:19257811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:19258103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B99,C26,C39
`Chr7:19258383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:19259229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,C83
`Chr7:19259261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B101,C5,D11,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773964.1

528 aa

264

528

PUB62-63_C

PF23112 PUB62-63_C 450-508 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773964.1`	Pfam	`PF23112`	PUB62-63_C	Domain	450	508	8.8e-37	125.3	U-box protein 62/63 C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917982.1
ATAGTAATTAGAAGTATAGGTAAGTAATATCAGTAGCATAATTTCCAAAACCCCAAAACCTCCCCAAACCCCAAATTGGCAAATTCTTCGCTGCATTTGAAATTCACCGATTAGTATTCATGCTGTGGAACGATCAGGAAGAAGCAAAATAATGATCGATGGTGGCGATGATGATGCCTCAGCATCAGAATCACGGCAATCCGCCGCCGAATTCCGCCGCCGCTGGTAGTATTAGATCCCCCCAGAACCACCACCTCCCT...

XM_057917981.1
TAGTAATTAGAAGTATAGGTAAGTAATATCAGTAGCATAATTTCCAAAACCCCAAAACCTCCCCAAACCCCAAATTGGCAAATTCTTCGCTGCATTTGAAATTCACCGATTAGTATTCATGCTGTGGAACGATCAGGAAGAAGCAAAATAATGATCGATGGTGGCGATGATGATGCCTCAGCATCAGAATCACGGCAATCCGCCGCCGAATTCCGCCGCCGCTGGTAGTATTAGATCCCCCCAGAACCACCACCTCCCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993196
ATGGTGGCGATGATGATGCCTCAGCATCAGAATCACGGCAATCCGCCGCCGAATTCCGCCGCCGCTGGTAGTATTAGATCCCCCCAGAACCACCACCTCCCTTCGCCGTCCCCTCTCTCTCTCGACGCGCCCTGCAGAGTTCGCCTCGCCGACATCTTGCCCTACGATGGAGCTCCCATGGCTCCCTACTTGAGGGCCGTGGATGCCTTGTCCGCCTCCCTCATGCGCCACAACGCCGCAGTCATTGAGCTCGGCTCCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773964.1
MVAMMMPQHQNHGNPPPNSAAAGSIRSPQNHHLPSPSPLSLDAPCRVRLADILPYDGAPMAPYLRAVDALSASLMRHNAAVIELGSEDAALLRCALESARLYFRTRKGGRGVYTYRAGRPLEDVDSSPPCLSDIFRCMGRAARAALCAISRHLRLRSDVFNHLLDDSPLPTSEPSSSILVATFSQISSQPGKIAPVGGKLASNCEVEKGLLMLVSSDAPGFQVCDPNGRWYQADGSLSPGDLLLLTGKALSHATAGLRHA...

XP_057773965.1
MVAMMMPQHQNHGNPPPNSAAAGSIRSPQNHHLPSPSPLSLDAPCRVRLADILPYDGAPMAPYLRAVDALSASLMRHNAAVIELGSEDAALLRCALESARLYFRTRKGGRGVYTYRAGRPLEDVDSSPPCLSDIFRCMGRAARAALCAISRHLRLRSDVFNHLLDDSPLPTSEPSSSILVATFSQISSQPGKIAPVGGKLASNCEVEKGLLMLVSSDAPGFQVCDPNGRWYQADGSLSPGDLLLLTGKALSHATAGLRHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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