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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002128`

染色体: Chr07 坐标: 19422172-19429007 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002128`
名称	SmilChr07G002128
描述	serine carboxypeptidase-like 34
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19422172 - 19429007 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993209`
GeneID	`130993209`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993209`
原始查询	`SmilChr07G002128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase-like 34
产物	serine carboxypeptidase-like 34
Arabidopsis	`AT5G23210` (SCPL34) serine carboxypeptidase-like 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832385] identity=65.1; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0634700` (OsSCP8) - identity=62.4; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0005773 (vacuole); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993209

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057774001.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057773999.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057773999.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774001.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19422413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B45
`Chr7:19422469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B117,B93
`Chr7:19426704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:19428620`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B109
`Chr7:19428620`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B109
`Chr7:19428883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773999.1

477 aa

238

477

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 39-469 aa

XP_057774000.1

476 aa

238

476

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 39-468 aa

XP_057774001.1

467 aa

234

467

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 39-459 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773999.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	39	469	2.9e-146	488.8	Serine carboxypeptidase
`XP_057774000.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	39	468	1.6e-145	486.4	Serine carboxypeptidase
`XP_057774001.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	39	459	8.8e-134	447.7	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918017.1
AAATGCTTGTATATATTTAAAATATTAATTAACTCGAGATAGGATATTTCCTCTCTCACTACTATAAATACACACACACACGTACACCAAAATTATTAAGACTAGAGCTTAACTAACAAAAAATTCTCATCAGAGAGAGAGATGCAGAAGGCGATGATGCATCTCGACATTCATGTGTTATTATTAATATTAATGGCGGCGGTTGTGGCGGGGGGCATGAGGGCGGAGCAAGAGGCGGATCGAGTGGCGGCGCTGCCGGG...

XM_057918018.1
ATGCTTGTATATATTTAAAATATTAATTAACTCGAGATAGGATATTTCCTCTCTCACTACTATAAATACACACACACACGTACACCAAAATTATTAAGACTAGAGCTTAACTAACAAAAAATTCTCATCAGAGAGAGAGATGCAGAAGGCGATGATGCATCTCGACATTCATGTGTTATTATTAATATTAATGGCGGCGGTTGTGGCGGGGGGCATGAGGGCGGAGCAAGAGGCGGATCGAGTGGCGGCGCTGCCGGGGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130993209
ATGCAGAAGGCGATGATGCATCTCGACATTCATGTGTTATTATTAATATTAATGGCGGCGGTTGTGGCGGGGGGCATGAGGGCGGAGCAAGAGGCGGATCGAGTGGCGGCGCTGCCGGGGCAGCCGGCGGTGAGCTTCAAGCAGTATGCAGGGTACGTGACTGTGAACGAGAGTCATGGCAGAGCACTGTTTTATTGGTTTTTTGAGGCCACCAAAAATCCTCAAAGAAAACCTCTCCTCTTGTGGCTTAATGGAGGTCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057773999.1
MQKAMMHLDIHVLLLILMAAVVAGGMRAEQEADRVAALPGQPAVSFKQYAGYVTVNESHGRALFYWFFEATKNPQRKPLLLWLNGGPGCSSIGYGQSEELGPFFPQKGKPELKLNNNSWNKAANLLFLESPVGVGFSYTNTSKDLKDHIGDTITAQDSYNFLLGWFRRFPQFKSHEFYIAGESYAGHYVPQLAELIVEENKKASDDDHINLKGIMIGNAAIDSETDQKGLIDYAWHHAVISDELYEKIKKKCNFKLENVS...

XP_057774000.1
MQKAMMHLDIHVLLLILMAAVVAGGMRAEQEADRVAALPGQPAVSFKQYAGYVTVNESHGRALFYWFFEATKNPQRKPLLLWLNGGPGCSSIGYGQSEELGPFFPQKGKPELKLNNNSWNKAANLLFLESPVGVGFSYTNTSKDLKDHIGDTITAQDSYNFLLGWFRRFPQFKSHEFYIAGESYAGHYVPQLAELIVEENKKASDDDHINLKGIMIGNAAIDSETDQKGLIDYAWHHAVISDELYEKIKKKCNFKLENVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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