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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002134`

染色体: Chr07 坐标: 19493189-19498483 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002134`
名称	SmilChr07G002134
描述	uncharacterized SmilChr07G002134
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19493189 - 19498483 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993936`
GeneID	`130993936`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993936`
原始查询	`SmilChr07G002134`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G51690` (AT3G51690) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824332] identity=37.4; qcov=0.154; evalue=2.01e-32; confidence=weak
Rice	`Os04g0357300` - identity=36.5; qcov=0.346; evalue=1.68e-80; confidence=low
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF14214 (Helitron_like_N); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993936

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774955.1`
2	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057774955.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057774955.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774955.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774955.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19493257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C25
`Chr7:19493266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:19493288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B78
`Chr7:19493289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr7:19493397`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A6,B115,B134,B78,C26,C83,D4
`Chr7:19493420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C61,C81
`Chr7:19493420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C61,C81
`Chr7:19493439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:19493569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:19493715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B42,B43,B65,C6
`Chr7:19493730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B33
`Chr7:19493734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B42,B43,B65,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774955.1

1289 aa

644

1289

Helitron_like_N

PIF1

Pif1_2B_dom

PF14214 Helitron_like_N 273-454 aa PF05970 PIF1 856-1076 aa PF21530 Pif1_2B_dom 1177-1222 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774955.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	273	454	3.6e-52	178.1	Helitron helicase-like domain at N-terminus
`XP_057774955.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	856	1076	7.6e-94	314.2	PIF1-like helicase
`XP_057774955.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	1177	1222	2.5e-19	69.5	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918972.1
ATGTGGATTGAAGAAAATGTAGAACATTCCAAGTCATCCAACCCAATATTCTCACTATGTTGCAAGAAGGGTAAAGTCGTTCTTCCACCATTGCAAAAACCGCCTCAGCTGTTGAGCGACCTTCTGGAAAATAGGCACGAAAAGAGCAAGAAATTTATCGAGGATATTCGTGCTTATAATATGATGTTCTCATTCACCTCGATGGGTGGAAAATTGGATTATTCCATAAATCAAGGTGTCGGACCATATACGTTTCGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993936
ATGTGGATTGAAGAAAATGTAGAACATTCCAAGTCATCCAACCCAATATTCTCACTATGTTGCAAGAAGGGTAAAGTCGTTCTTCCACCATTGCAAAAACCGCCTCAGCTGTTGAGCGACCTTCTGGAAAATAGGCACGAAAAGAGCAAGAAATTTATCGAGGATATTCGTGCTTATAATATGATGTTCTCATTCACCTCGATGGGTGGAAAATTGGATTATTCCATAAATCAAGGTGTCGGACCATATACGTTTCGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774955.1
MWIEENVEHSKSSNPIFSLCCKKGKVVLPPLQKPPQLLSDLLENRHEKSKKFIEDIRAYNMMFSFTSMGGKLDYSINQGVGPYTFRLRDEEIQHRKNVVSKGKSNDFDDSIVNDLKQMIDESSPYAKIYRMAADHISRDNSVDVKLRLIGKRSRDGRTYNMPTTTEVAALIVGDFECMPDKRDVIVEKRNGELQCINEFHPSYLPLQYPLIFIYGEDVFYLDIPHNESQSSALAKKRKTKKNESQSSDPSKKRKRNEEES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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