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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002138`

染色体: Chr07 坐标: 19523639-19526658 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002138`
名称	SmilChr07G002138
描述	uncharacterized SmilChr07G002138
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19523639 - 19526658 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993218`
GeneID	`130993218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993218`
原始查询	`SmilChr07G002138`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821018]; symbol=AT3G02820; hit=AT3G02820; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821018]; symbol=AT3G02820; hit=AT3G02820; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G02820` (AT3G02820) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821018] identity=41.9; qcov=0.99; evalue=1.03e-67; confidence=medium
Rice	`Os02g0762200` - identity=40.2; qcov=1.06; evalue=1.22e-60; confidence=medium
GO	GO:0000076 (DNA replication checkpoint signaling); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006974 (DNA damage response); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0031297 (replication fork processing); GO:0031298 (replication fork protection complex); GO:0043111 (replication fork arrest)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF07962 (Swi3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774009.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057774009.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774009.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774009.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774009.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19523898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C27
`Chr7:19523900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:19523904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B117,B93,C39,C60
`Chr7:19523910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B34,C3
`Chr7:19526427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B103
`Chr7:19526439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B96
`Chr7:19526489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774009.1

294 aa

147

294

zf-CCHC

Swi3

PF00098 zf-CCHC 16-32 aa PF07962 Swi3 83-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774009.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	16	32	4.2e-08	33.6	Zinc knuckle
`XP_057774009.1`	Pfam	`PF07962`	Swi3	Family	83	164	2.6e-25	88.9	Replication Fork Protection Component Swi3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918026.1
GAAGTTTCCCCTCACAAAAAGAAGGAAAAACAAAAATAAAAAACAAAAAAGGAGTAAATGTTTCCCCTCCAAATTCTCCCGCCAAAAACAACAAAGGAGTATATACTTTAATGGCTGGCTCCCAATTTTCTCCTAGGGCTACTAGCAACGACGAAGAATGAATCAGGGCGCCGGCGTTAATGGCGGTGGCGCGGCCCCAACTGGCTGCTACAAGTGCGGCCGCCCCGGCCACTGGTCGCGGGACTGTCCTTCCGACCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993218
ATGAATCAGGGCGCCGGCGTTAATGGCGGTGGCGCGGCCCCAACTGGCTGCTACAAGTGCGGCCGCCCCGGCCACTGGTCGCGGGACTGTCCTTCCGACCCCAACACTTCCGAAACCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACACTTCCGACCTCGATCCAAACTCAAGGTTCACTTCGAGGCCGCCCTTCCCCGCACAGAAGCCCAAGCAGAAGCCGCCGAGAAGAGTCAGGCCCAAGCTCACTCCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774009.1
MNQGAGVNGGGAAPTGCYKCGRPGHWSRDCPSDPNTSETNNNNNNNNNNNNTSDLDPNSRFTSRPPFPAQKPKQKPPRRVRPKLTPDLLLSDAGIGHILRYFPPALKCRGRGHEVDDLRHLLRMYADWHSRLLPYYNFEQFVDKVERVGSSKRVKVCLRELRDKISNGIDLIKLQEPQVQQDSVDEQDNTSGLNMPSNIQENNNMQTEDNNNFQEDMPQSIWEEATQEPSQSVHIEDVADISRAEEVPNQTVEANPGSSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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