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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002149`

染色体: Chr07 坐标: 19664461-19669092 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002149`
名称	SmilChr07G002149
描述	F-box/LRR-repeat protein 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19664461 - 19669092 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993234`
GeneID	`130993234`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993234`
原始查询	`SmilChr07G002149`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein 4
产物	F-box/LRR-repeat protein 4
Arabidopsis	`AT5G23340` (AT5G23340) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832398] identity=71.2; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0636400` - identity=55.4; qcov=0.473; evalue=6.13e-67; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF13516 (LRR_6); PF25372 (LRR_FBXL15)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774036.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774036.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774036.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774036.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774036.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19664934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B31,C45
`Chr7:19665213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr7:19665455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:19665575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B56,B96
`Chr7:19667300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B51,C4
`Chr7:19667387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B3,B66,C46
`Chr7:19667485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B33,C1,C5,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774036.1

408 aa

204

408

LRR_FBXL15

LRR_6

LRR_FBXL15

LRR_6

PF25372 LRR_FBXL15 86-174 aa PF13516 LRR_6 101-122 aa PF13516 LRR_6 126-148 aa PF25372 LRR_FBXL15 175-380 aa PF13516 LRR_6 176-199 aa PF13516 LRR_6 206-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774036.1`	Pfam	`PF25372`	LRR_FBXL15	Repeat	86	174	4.6e-27	95.3	F-box/LRR-repeat protein 15, leucine rich repeat domain
`XP_057774036.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	101	122	4.8e-24	83.2	Leucine Rich repeat
`XP_057774036.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	126	148	4.8e-24	83.2	Leucine Rich repeat
`XP_057774036.1`	Pfam	`PF25372`	LRR_FBXL15	Repeat	175	380	4.6e-27	95.3	F-box/LRR-repeat protein 15, leucine rich repeat domain
`XP_057774036.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	176	199	4.8e-24	83.2	Leucine Rich repeat
`XP_057774036.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	206	226	4.8e-24	83.2	Leucine Rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918053.1
GCTGATTTTCAACTTGCACATGAACATTATTTTTTGTCTGCAATTCCATCAATTTAATGACTTGTTCAATTTTTCCACACTTTTGAACTCCGATGAAGTATTGATCTTACTTAGCGCCTACATGGTGGTATCGAGCTGATATGGCGCCTATTTAGACTGAAAATTTGACACTTGGAAAACAATAAACAAAAAATTAAAAATCATCCCCTTCTCCAAACTGCCGTTCCATTAACCCTTCCTCCGTCGCCTCCACCTTCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993234
ATGGCCCAGCCCCAAGACGGCATTAACGAGAGACTGGGCGACGACGAGCTCCGAGCCGTCCTCTCCAAGCTCCAAGATGACAAGGACAAGGAGCTCTTCGGCCTTGTCTGCAAAAGGTGGCTCCATCTCCAGAGCATCGAGAGGCGCAAGCTCTCTGCCCGCGCCGGCCCCCACATGCTCAACCGCCTCGCCGCCCGATTCACGCGCCTCCGCGAGCTCGACCTCTCTCAGTCCGTCTCCCGCTCCTTCTATCCCGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774036.1
MAQPQDGINERLGDDELRAVLSKLQDDKDKELFGLVCKRWLHLQSIERRKLSARAGPHMLNRLAARFTRLRELDLSQSVSRSFYPGVTDSDLSVIAAAFSSLRLLNLQNCKGITDKGLASLASGIPSLQFLDVSYCRKLTDKGLSSIARGCCDLRALYVVGCRFVTDALLSALSMNCRNLEELSLQGCSNITDSGLTVLVKGCKRLKQLDLNKCSNIGDIGISSISKACSSSLLTLKLLDCYKIGDESIISLAKHCKNLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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