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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002158`

染色体: Chr07 坐标: 19728434-19735484 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002158`
名称	SmilChr07G002158
描述	uncharacterized SmilChr07G002158
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19728434 - 19735484 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993225`
GeneID	`130993225`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993225`
原始查询	`SmilChr07G002158`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase inhibitor (DUF639) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832403]; symbol=AT5G23390; hit=AT5G23390; species=arabidopsis; confidence=high
产物	polygalacturonase inhibitor (DUF639) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832403]; symbol=AT5G23390; hit=AT5G23390; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G23390` (AT5G23390) polygalacturonase inhibitor (DUF639) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832403] identity=56.2; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0637800` (OJ1581_H09.29-1) - identity=48.8; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04842 (DUF639)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993225

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057774019.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057774019.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057774019.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774019.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774019.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19728593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B131,B9,C31
`Chr7:19730463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C61
`Chr7:19730472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C61
`Chr7:19731352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B108,B35
`Chr7:19731836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B60,B79,C36
`Chr7:19734074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B44,B55,C45
`Chr7:19734092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:19734175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C61
`Chr7:19734213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C61
`Chr7:19735182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B35
`Chr7:19735184`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B93,C61
`Chr7:19735184`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B93,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774019.1

723 aa

362

723

DUF639

PF04842 DUF639 491-715 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774019.1`	Pfam	`PF04842`	DUF639	Family	491	715	2.3e-64	217.7	Plant protein of unknown function (DUF639)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918036.1
AAGCGTTTTGACTATTTATAGTATCTCCAAATTCTTCTCCAATTTATGATGCCACCGATACACACACCATTTTTTTATACGTGCAGATGCTTACGTCGAGCGACGAAGAAAAGAATCTCTCTCAAATTTTGAGTCGGCAAATTAAGCTGAACCAAATCCTTAAAAACTTGGGGTTTTCGATTTCCGCGGGCGATTTCGGGATCAATGGAGACGGACAATGCAGAACCGGCGGCAAGGAACGACAGCCTCTGGCTTTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993225
ATGGAGACGGACAATGCAGAACCGGCGGCAAGGAACGACAGCCTCTGGCTTTTGAAATCAATTTTCTCGAAGAAGAGCAGCGCCGACGGCGGCGCCGACGCCGCTGCCAAGAACCCGCCCAACAATAATCCGCCGCTTCCTTTTCTCTCACCTCACGCCAACTCCGTTGTCGCTCGTTGCTCCAAGATTCTTGGCATATCAACCAAAGAGTTACAGGCCCTGTTCGATGTAGAACTACCTGATAATCTCAGACAGCCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774019.1
METDNAEPAARNDSLWLLKSIFSKKSSADGGADAAAKNPPNNNPPLPFLSPHANSVVARCSKILGISTKELQALFDVELPDNLRQPPSYARNFLEFCSYKALHLAITKPNYLTDKEFCRLTFDMMIAWEDPGVDSNLIDDETASCSNQDVESEDGWSLFYSNSTKMAVQVDDKKTVGPEAFARIAPACPVIADVTTVHNLFDVLISASGPRLHFLIYDKYLRSLEKVAKSAQNALGPQVIASLSLADDEIIIDVDGTVPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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