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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002164`

染色体: Chr07 坐标: 19798184-19811912 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002164`
名称	SmilChr07G002164
描述	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19798184 - 19811912 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993224`
GeneID	`130993224`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993224`
原始查询	`SmilChr07G002164`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4-like
产物	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4-like
Arabidopsis	`AT1G10870` (AGD4) ARF-GAP domain 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837629] identity=62.1; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0632500` - identity=55; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00023 (Ank); PF00169 (PH); PF01412 (ArfGap); PF03114 (BAR); PF12796 (Ank_2); PF13606 (Ank_3); PF13637 (Ank_4); PF16746 (BAR_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993224

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774018.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057774018.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057774018.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057774018.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057774018.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19799944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:19799996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B56,B96,D11
`Chr7:19800128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B111
`Chr7:19802219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr7:19802558`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr7:19802558`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B67
`Chr7:19802964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr7:19802985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C23,D10
`Chr7:19803941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C35
`Chr7:19804001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr7:19805353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:19809307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774018.1

816 aa

408

816

BAR_3

BAR

ArfGap

Ank_2

Ank_3

Ank

Ank_4

Ank

PF16746 BAR_3 43-273 aa PF03114 BAR 55-251 aa PF00169 PH 331-462 aa PF01412 ArfGap 510-636 aa PF12796 Ank_2 706-787 aa PF13606 Ank_3 724-751 aa PF00023 Ank 724-754 aa PF13637 Ank_4 728-777 aa PF00023 Ank 756-787 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774018.1`	Pfam	`PF16746`	BAR_3	Domain	43	273	2e-37	129.8	BAR domain of APPL family
`XP_057774018.1`	Pfam	`PF03114`	BAR	Domain	55	251	2.8e-13	50.8	BAR domain
`XP_057774018.1`	Pfam	`PF00169`	PH	Domain	331	462	9.8e-15	55.7	PH domain
`XP_057774018.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	510	636	2.3e-32	112.3	Putative GTPase activating protein for Arf
`XP_057774018.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	706	787	6.6e-12	46.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057774018.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	724	751	3.9e-10	39.7	Ankyrin repeat
`XP_057774018.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	724	754	9.8e-12	45.2	Ankyrin repeat
`XP_057774018.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	728	777	1.7e-06	28.9	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057774018.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	756	787	9.8e-12	45.2	Ankyrin repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918035.1
TTGAATTTGGCACCAAATTAATGACAGTATATTTGCCGACAGGCTGGCGTCACCACCAATCTGACCAACGAAGGAAACACCTTTCAGTGGTAACGACGTCGTTTCTTGTATGTCCCACTCCGACACATCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTTCCTCTTTCTCTTTCCCCGCCGGATCTCAATTTTCCTTCTACGGACTATCCGAACTCATCACCCAAGAAATGGCCACATTTATCAGGCTCGACGATTCCCCCATGTTCCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993224
ATGTCCCACTCCGACACATCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTTCCTCTTTCTCTTTCCCCGCCGGATCTCAATTTTCCTTCTACGGACTATCCGAACTCATCACCCAAGAAATGGCCACATTTATCAGGCTCGACGATTCCCCCATGTTCCAGAAACAGGTGCGATCTCTGGAGCAGACATCGGATGAGTTAAGAGATCGATGCCAGAAGCTGTACAAAAGCTGTAAGAAGTACACGGATATGCTGGGTGAAGCATTCAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774018.1
MSHSDTSLSLSSSSSFSFPAGSQFSFYGLSELITQEMATFIRLDDSPMFQKQVRSLEQTSDELRDRCQKLYKSCKKYTDMLGEAFNGDMSFAASLEAFGGGLDDLLGVSIGGPVLSKFINALRELATYKEFLRSQVEHVLVDRLSQFLSVDLQDAKESRRRFDKAIYTYDQAREKFASLKKTTRDEVVAELEEDLQNSKSAFERSRFNLVNALTNVEAKKKFEFLESFSAIMDAHLRFYKLGFNLLNQMEPFIHQVLTYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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