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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002165`

染色体: Chr07 坐标: 19821034-19822641 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002165`
名称	SmilChr07G002165
描述	TSA1-like protein
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19821034 - 19822641 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993939`
GeneID	`130993939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993939`
原始查询	`SmilChr07G002165`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TSA1-like protein
产物	TSA1-like protein
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774959.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057774959.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057774959.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774959.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774959.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19821042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,B75
`Chr7:19821058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B130,B135,B21,B65
`Chr7:19821064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A3,B122,B135,B136,B140,B22,B32,B49,B60,B64,B70,B71,B72,B99,C1,C26,C49,C52,C56,C64,C66,C74,C83,C85
`Chr7:19821074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B118,C27,C55,C70
`Chr7:19821079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B93
`Chr7:19821079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:19821081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr7:19821125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C37
`Chr7:19821151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	41	A13,A16,A5,A8,B1,B114,B133,B134,B138,B16,B17,B18,B26,B29,B30,B31,B32,B55,B75,B79,B80,B90,B92,B94,B97,C10,C13,C21,C23,C25,C3,C36,C38,C43,C49,C51,C71,C85,D1,D7,D9
`Chr7:19821153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B54,B95,C28,C76
`Chr7:19821167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C55
`Chr7:19821168`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B91,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774959.1

487 aa

244

487

zf-CCHC

PF00098 zf-CCHC 152-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774959.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	152	167	0.00019	22.1	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918976.1
ATGAATAACACACTCAGTGTTAACGAAGTACAATTTGAATGCTTCCAGTACACGCCGCATTTAATGCAAAGGACAGTGCATTTAATGCAAGGATATGGTGAATCGTCCTTCACCCTGCAGAGTTTTCATTTTCGTGTACCTTACACTGACAACAAGAAAGCTGGAACCTCGGATGATGATGCCCCCTCAGCCTCCAAAGGAGCAGCACTGAAGGCTACATCCAAAGATTCCAAGAAGCAGTCGGAAGAGTCGACTGATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993939
ATGAATAACACACTCAGTGTTAACGAAGTACAATTTGAATGCTTCCAGTACACGCCGCATTTAATGCAAAGGACAGTGCATTTAATGCAAGGATATGGTGAATCGTCCTTCACCCTGCAGAGTTTTCATTTTCGTGTACCTTACACTGACAACAAGAAAGCTGGAACCTCGGATGATGATGCCCCCTCAGCCTCCAAAGGAGCAGCACTGAAGGCTACATCCAAAGATTCCAAGAAGCAGTCGGAAGAGTCGACTGATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774959.1
MNNTLSVNEVQFECFQYTPHLMQRTVHLMQGYGESSFTLQSFHFRVPYTDNKKAGTSDDDAPSASKGAALKATSKDSKKQSEESTDTKNEDFFNQYSLMTERFNKMESRFRKYKKFHKNNFKGMENEYKPRYSNNKFEEKKPSTPDLKDAECFSCGKKGHYKTDCPEISYSEHKALRAKRDRRNEKNKTMVAEDAEDSNYSTESSSSNSTSSDDESQTLMAKDTESVVDNNFNSYDSGLDRPEVNSHSKTFNIDISLMMT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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