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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002185`

染色体: Chr07 坐标: 20067037-20068824 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002185`
名称	SmilChr07G002185
描述	protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20067037 - 20068824 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993267`
GeneID	`130993267`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993267`
原始查询	`SmilChr07G002185`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1-like
产物	protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1-like
Arabidopsis	`AT4G17900` (AT4G17900) PLATZ transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827514] identity=58.4; qcov=0.987; evalue=3.88e-86; confidence=high
Rice	`Os04g0591100` - identity=58.8; qcov=1.02; evalue=1.57e-87; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04640 (PLATZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993267

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774078.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774078.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774078.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774078.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774078.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20067925`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	42	A2,A23,B1,B106,B107,B11,B114,B117,B118,B120,B121,B131,B18,B23,B26,B41,B5,B50,B57,B6,B64,B65,B72,B73,B74,B9,B90,B96,B98,C18,C2,C28,C38,C44,C45,C46,C57,C60,C85,C9,D11,D8
`Chr7:20067926`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	41	A2,A23,B1,B106,B107,B11,B114,B117,B118,B120,B121,B131,B18,B23,B26,B41,B5,B50,B57,B6,B64,B65,B72,B73,B74,B9,B90,B96,C18,C2,C28,C38,C44,C45,C46,C57,C60,C85,C9,D11,D8
`Chr7:20067945`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	52	A1,A2,A21,A23,B1,B106,B107,B110,B117,B118,B131,B18,B19,B23,B4,B42,B48,B5,B50,B57,B6,B65,B72,B73,B74,B75,B77,B8,B9,B90,B94,B96,C18,C26,C27,C29,C38,C43,C44,C46,C50,C59,C65,C67,C69,C76,C78,C79,C9,D1,D11,D4
`Chr7:20067969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr7:20067975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	93	A1,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A3,A5,A8,B1,B104,B106,B107,B11,B110,B113,B114,B115,B117,B118,B121,B124,B126,B131,B132,B134,B140,B18,B19,B23,B28,B31,B34,B4,B42,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B57,B6,B65,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B8,B9,B90,B94,B96,B97,B98,C14,C18,C21,C23,C26,C27,C28,C29,C38,C43,C44,C46,C47,C50,C59,C65,C66,C67,C69,C71,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C9,D1,D11,D2,D4,D8,D9
`Chr7:20067976`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	77	A1,A16,A18,A2,A20,A21,A23,A3,A5,B1,B104,B106,B107,B110,B113,B115,B117,B118,B124,B126,B131,B132,B134,B140,B18,B19,B23,B28,B31,B42,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B57,B6,B65,B71,B72,B73,B74,B75,B78,B8,B9,B90,B94,B96,B97,C14,C18,C21,C26,C27,C29,C38,C44,C46,C50,C65,C66,C67,C71,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C9,D1,D11,D2,D4,D9
`Chr7:20067979`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B19,B34,B4,B53,B74,B77,B98,C43,C57,C59,C69
`Chr7:20067980`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	80	A1,A16,A18,A2,A20,A21,A23,A3,A5,B1,B102,B104,B106,B107,B110,B113,B115,B117,B118,B124,B126,B131,B132,B134,B140,B18,B19,B23,B28,B31,B42,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B57,B58,B6,B65,B71,B72,B73,B74,B75,B78,B8,B86,B9,B90,B94,B96,B97,C14,C18,C21,C26,C27,C29,C38,C44,C46,C50,C65,C66,C67,C71,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C9,D1,D11,D2,D4,D9
`Chr7:20067992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B21,D8
`Chr7:20067995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:20068001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C18,C67
`Chr7:20068003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B11,B21,B98,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774078.1

224 aa

112

224

PLATZ

PF04640 PLATZ 74-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774078.1`	Pfam	`PF04640`	PLATZ	Family	74	148	4.7e-29	101.5	PLATZ transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918095.1
GAAATGGGCAAATTTAAGGAGGTGGGAGAGTACATTTTAGTCAAATTTAGGGGGCCAATGCCAAACGATCCCACTTAAAAGTAATAAATTAAGTAAATGAAATAAATTGAGGAGATTAGGCATTAGTCATGCAAGAAAAATAAAAATAAGAGTTGAAGTATAGTGTCATAAATCGGTAATGGAAAAAAAGAAACGTCTTGGCTTTTCCCATTGCCTTAGAGTCTAAAATCTGAAAGTTCTTAGCCTTTCCCTTTCTTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993267
ATGGGCGGTGTATACGGCGGCGGAGAAGACGACGACAGCAGCAGCAAGTGGCCGCCGTGGCTGCGGCCGCTGCTGCAGAGCAGCTTCTTCGGCCAATGCAAGGTGCACGCGGCGGCGGCGCACAAGAGCGAGTGCAACATGTTCTGCTTGGATTGCGTCGACGGACCGCTCTGCTCACTTTGCCTCAACTTTCACAAGGATCACCGCCCTATCCAGATACGGAGATCGTCGTACCACGACGTGATTAGAGTTGGGGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774078.1
MGGVYGGGEDDDSSSKWPPWLRPLLQSSFFGQCKVHAAAAHKSECNMFCLDCVDGPLCSLCLNFHKDHRPIQIRRSSYHDVIRVGEIQKYLDITGVQTYIINSAKIVFLNQRRRPQPRPGKGAATNTCCVCDRSLLDSFTFCSIGCKIVGTSKNFDKEKIRMDDGGASDSDESSESMNAASIHKQVVRSKVQGFTPSTPPQTAAAKRRKGVPRRAPTGGLLLGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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