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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002188`

染色体: Chr07 坐标: 20095680-20098851 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002188`
名称	SmilChr07G002188
描述	uncharacterized SmilChr07G002188
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20095680 - 20098851 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993270`
GeneID	`130993270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993270`
原始查询	`SmilChr07G002188`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plasma protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842810]; symbol=AT1G65020; hit=AT1G65020; species=arabidopsis; confidence=high
产物	plasma protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842810]; symbol=AT1G65020; hit=AT1G65020; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G65020` (AT1G65020) plasma protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842810] identity=57.3; qcov=0.966; evalue=4.35e-123; confidence=high
Rice	`Os10g0577000` - identity=46.7; qcov=1.01; evalue=4.96e-110; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08378 (NERD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057774081.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057774081.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057774081.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057774081.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20095855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A7,B103,B30,B84
`Chr7:20095918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:20096055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C65
`Chr7:20096297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr7:20096641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,C37,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774081.1

325 aa

162

325

NERD

PF08378 NERD 38-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774081.1`	Pfam	`PF08378`	NERD	Family	38	133	4.1e-13	50.5	Nuclease-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918098.1
CAGTAGTAGCCGAATTAGATGAGAAAACAAAATTGCAGGTCATATTCATATTCGAATATGCAGCTTCCCCAAAAGTGAAGTATTTAATGAGGTTGATAATAGTGGAGTAGAGTAGCAAAGCAAAGATGTGGATTGCAGTGATAAGCGGTTTGATTATTTACCTTATAGTGAAGCTCTTCCTCTACGAGGACGACACCCTCCTCGATCTCTCCTCCTCCCACTTCAGCGCCCTCTTCACCGTCGCCAAAAGGCTGGAAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993270
ATGTGGATTGCAGTGATAAGCGGTTTGATTATTTACCTTATAGTGAAGCTCTTCCTCTACGAGGACGACACCCTCCTCGATCTCTCCTCCTCCCACTTCAGCGCCCTCTTCACCGTCGCCAAAAGGCTGGAAAAGCTTTATCATGGAAGCAAAGTCTACATTGGCCTCCAAATTCCGGACGCCGATTCCGCTTCTCGCCAGAATATTGATCTTGTTCTCGTCACTCAAGAGGGGGCTATGGTGATTTCGGTGAAGAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774081.1
MWIAVISGLIIYLIVKLFLYEDDTLLDLSSSHFSALFTVAKRLEKLYHGSKVYIGLQIPDADSASRQNIDLVLVTQEGAMVISVKNMSGFVSTDKDGNWVCTDGKHHRTDLIPNPVPETKRLVPILEEYLEQRGVALPEGYLSVKVICPNPSFSSIDSDSFPPEVITYDQWKILKPGQRSLYSGWIKGVLGGGKDKTQDSFYEQVNSVLSTAPISDRLELKGNKYVLGEFIEFKGKEEDLHGLRKIKRSKISQLSVQKIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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