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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002192`

染色体: Chr07 坐标: 20144874-20148054 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002192`
名称	SmilChr07G002192
描述	syntaxin-21-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20144874 - 20148054 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993274`
GeneID	`130993274`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993274`
原始查询	`SmilChr07G002192`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	syntaxin-21-like
产物	syntaxin-21-like
Arabidopsis	`AT5G46860` (VAM3) Syntaxin/t-SNARE family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834730] identity=48.6; qcov=0.963; evalue=1.14e-78; confidence=high
Rice	`Os01g0254900` - identity=47.2; qcov=1; evalue=8.75e-72; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006906 (vesicle fusion); GO:0012505 (endomembrane system); GO:0016020 (membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0048278 (GO:0048278)
KEGG	-
Pfam	PF05739 (SNARE); PF14523 (Syntaxin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993274

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057774085.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057774085.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057774085.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057774085.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057774086.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20145161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C26
`Chr7:20145164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:20145183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B93,C70
`Chr7:20145206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:20145213`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A14,B10,B121,B45,B98,C12,C35,C38,D3
`Chr7:20145363`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B121,B6
`Chr7:20145363`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B121,B6
`Chr7:20145392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,B99,C26
`Chr7:20145399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr7:20145420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B119,B131,B9,C31
`Chr7:20145560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:20145573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774085.1

271 aa

136

271

Syntaxin_2

SNARE

PF14523 Syntaxin_2 27-153 aa PF05739 SNARE 180-257 aa

XP_057774086.1

269 aa

134

269

Syntaxin_2

SNARE

PF14523 Syntaxin_2 27-151 aa PF05739 SNARE 178-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774085.1`	Pfam	`PF14523`	Syntaxin_2	Domain	27	153	1.1e-25	90.9	Syntaxin-like protein
`XP_057774085.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	180	257	1.8e-21	76.5	SNARE domain
`XP_057774086.1`	Pfam	`PF14523`	Syntaxin_2	Domain	27	151	1.8e-25	90.2	Syntaxin-like protein
`XP_057774086.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	178	255	1.8e-21	76.5	SNARE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918102.1
ATGAATGAGACCGTATATATATAGGAGGTGTCCCCACCACCACGTTTGTTAAAACTCAAAAAATTGGTAGCGGCGGCAACAATCCAACGCCGTTGCTAACTTCGTAAACGTCACACTCCTTCACCAATTCGTCTTCTATTATTTTCTCCGTCAAATCTCAATCAACCCTTTCGGAAGAAGAAGAAGTATTTCTTAATTCTTTGATCAATTCTACGATTGAATTAAACCGACAAAACAACTTCTTCCTCTTCTGCCGCTTC...

XM_057918103.1
TTAAAACTCAAAAAATTGGTAGCGGCGGCAACAATCCAACGCCGTTGCTAACTTCGTAAACGTCACACTCCTTCACCAATTCGTCTTCTATTATTTTCTCCGTCAAATCTCAATCAACCCTTTCGGAAGAAGAAGAAGTATTTCTTAATTCTTTGATCAATTCTACGATTGAATTAAACCGACAAAACAACTTCTTCCTCTTCTGCCGCTTCATCATTAGCTACCAAACCTGATTCTTATGACTTGATAATTCTTTGATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993274
ATGAGTTTTGAGGACCTCGAATCTGGCCGGGCTTTGATTCCTCTTGCGGGGCCTAGGCACATTGAGCAGGGCCCTTCTCGAGCCCTCGCCGCCGGCGTCTTCAGGATTAACACCGCCGTCGCAGGCTATAAACGCCTCGTCAATTGCATCGGAACTCCTAGAGATGCCGTCGACCTCCGTCATAATCTCCGTAAAACGAGGCTACAGATTAGGCAGCTGGTGAAGGAGACTTCGGCAGAGCTTGATCGTGTCCGAGAAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774085.1
MSFEDLESGRALIPLAGPRHIEQGPSRALAAGVFRINTAVAGYKRLVNCIGTPRDAVDLRHNLRKTRLQIRQLVKETSAELDRVRETYKFSEVNDSKKIADAKLTKDYESVLKDFEKAQLLAADKEKAFPHPIANNARQPSNRASELEISSLNPMQASLVREANRHVMHMENEIVLNEAIIEEREQGIREIQKEIGEVNDIFKDLAQLVSAQGSLIGDISSNIESSHASTGEAANQLTKASNTQRSTSSMTCLMLVIVGI...

XP_057774086.1
MSFEDLESGRALIPLAGPRHIEQGPSRALAAGVFRINTAVAGYKRLVNCIGTPRDAVDLRHNLRKTRLQIRQLVKETSAELDRVRETYKFSEVNDSKKIADAKLTKDYESVLKDFEKAQLLAADKEKAFPHPIANNARQPRASELEISSLNPMQASLVREANRHVMHMENEIVLNEAIIEEREQGIREIQKEIGEVNDIFKDLAQLVSAQGSLIGDISSNIESSHASTGEAANQLTKASNTQRSTSSMTCLMLVIVGIIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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