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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002195`

染色体: Chr07 坐标: 20153713-20162649 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002195`
名称	SmilChr07G002195
描述	cellulose synthase-like protein D2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20153713 - 20162649 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993275`
GeneID	`130993275`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993275`
原始查询	`SmilChr07G002195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cellulose synthase-like protein D2
产物	cellulose synthase-like protein D2
Arabidopsis	`AT3G03050` (CSLD3) cellulose synthase-like D3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821148] identity=80.3; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0111800` (OsCSLD2) - identity=79.9; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009833 (plant-type primary cell wall biogenesis); GO:0016760 (cellulose synthase (UDP-forming) activity); GO:0030244 (cellulose biosynthetic process); GO:0051753 (mannan synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03552 (Cellulose_synt); PF14570 (zf-RING_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993275

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057774087.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057774087.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057774087.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774087.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20158770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B15,C51
`Chr7:20158795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B20,B5,B62,D5
`Chr7:20159060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B104,B15,C51
`Chr7:20159062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B28,B65
`Chr7:20159118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B30,B84
`Chr7:20159219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,D2
`Chr7:20159275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C38
`Chr7:20159286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B30,B84
`Chr7:20159309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr7:20159345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:20159552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C38
`Chr7:20159556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B81,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774087.1

1152 aa

576

1152

zf-RING_4

Cellulose_synt

PF14570 zf-RING_4 136-184 aa PF03552 Cellulose_synt 381-1143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774087.1`	Pfam	`PF14570`	zf-RING_4	Domain	136	184	1.1e-15	57.8	RING/Ubox like zinc-binding domain
`XP_057774087.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	381	1143	0	1251.5	Cellulose synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918104.1
ATTCTCTCTATCGGCATAAATCATCTCCAGCAGCGTAAATCTTCTCACTGTAAAACTAAGCGAGGCTGCCGGAGCCGGAGCCATAAATCCTCCTCCATAGCCGCTACATCCCTGCAAAGAATATCTGAACGAGACGAGAATCAAATCAAACTTCACCTTTTTGACGTGGCAAGGTTTTGATGCTTGAAATGGCATCAAAACCATTTGAAACGAGCAGATCGGATCTATCAGCCATATCTGATGTACTGGACTCACACAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993275
ATGCTTGAAATGGCATCAAAACCATTTGAAACGAGCAGATCGGATCTATCAGCCATATCTGATGTACTGGACTCACACAACAGTAAGCCTCCATTGCCTCCACAAACGCGGGTGACATTTGCACGAAGGACTTCCTCAGGCCGTTATGTGAGCTACTCGAGGGATGATCTTGATAGCGAGCTTGGCAGCAGTGACTTCCTCAACTACACGGTGCAGATACCCCCAACCCCTGATAACCAACCTAGCAATCCTGTTGCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774087.1
MLEMASKPFETSRSDLSAISDVLDSHNSKPPLPPQTRVTFARRTSSGRYVSYSRDDLDSELGSSDFLNYTVQIPPTPDNQPSNPVAHKVEEQYVSNSLFTGGFNSITRAHLMDKVIDSDANHPQMAGVKGSSCAINGCDGKVMCDEKGDDILPCECDFKICRDCYIDVLKTGDGACPGCKDQYKTTDLDEAMENWMSLPQLPGPGERSKKMERRLSLVKSTKSSLLMKSQTGDFDHNRWLFETKGTYGYGNAIWPNENGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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