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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002198`

染色体: Chr07 坐标: 20212102-20212920 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002198`
名称	SmilChr07G002198
描述	uncharacterized SmilChr07G002198
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20212102 - 20212920 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993942`
GeneID	`130993942`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993942`
原始查询	`SmilChr07G002198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817994]; symbol=AT2G34320; hit=AT2G34320; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817994]; symbol=AT2G34320; hit=AT2G34320; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G34320` (AT2G34320) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817994] identity=25.9; qcov=0.908; evalue=4.22e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0630250` - identity=36; qcov=0.316; evalue=2.65e-07; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993942

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774962.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057774962.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774962.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057774962.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057774962.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20212133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:20212187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr7:20212211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B6,C63
`Chr7:20212254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr7:20212283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B113
`Chr7:20212283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr7:20212339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B115,B27,D10
`Chr7:20212354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B32
`Chr7:20212354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr7:20212359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B27,B88
`Chr7:20212375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D10
`Chr7:20212414`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774962.1

272 aa

136

272

RVT_3

PF13456 RVT_3 143-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774962.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	143	220	1.1e-10	42.2	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918979.1
ATGGATCACGTTCTGTTGAACTGTCCCTTCTCGGCTTCTATTTGGGCGGAAGTCTTTCGTTGGTTTTTGATTGAGAAACCTTTGCCGTTGAACGTGGGCAGCATGATTCGCTTCTCTATCCACCAGAACAACAGCAAACAAGTTGGCAATTTGTGGAAAGCTGGGGTGGTCTCTCTCCTCTGGAGTCTCTGGTCTCACCGCAATAACGTCATACACAAAAATTTAGCACCTTCGCGCCACTTGATTCTCAAGCAGGTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993942
ATGGATCACGTTCTGTTGAACTGTCCCTTCTCGGCTTCTATTTGGGCGGAAGTCTTTCGTTGGTTTTTGATTGAGAAACCTTTGCCGTTGAACGTGGGCAGCATGATTCGCTTCTCTATCCACCAGAACAACAGCAAACAAGTTGGCAATTTGTGGAAAGCTGGGGTGGTCTCTCTCCTCTGGAGTCTCTGGTCTCACCGCAATAACGTCATACACAAAAATTTAGCACCTTCGCGCCACTTGATTCTCAAGCAGGTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774962.1
MDHVLLNCPFSASIWAEVFRWFLIEKPLPLNVGSMIRFSIHQNNSKQVGNLWKAGVVSLLWSLWSHRNNVIHKNLAPSRHLILKQVRVFLCEAANNFVLGTMANSVSDLLILKNISIAGQPRKPFSYIYVAWHLPPPSWIKVNTDGSVREGRIHAGGVFRNAFNDVLGCYHFSGGQGVAFEAELLAIIIAIESLHRAKWERVWFESDSSYVVQLLQSHSETVPWRFKPRWQLALSKLSHGAFPTFFVRATDRRIFWLLKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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