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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002200`

染色体: Chr07 坐标: 20235440-20237347 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002200`
名称	SmilChr07G002200
描述	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20235440 - 20237347 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993280`
GeneID	`130993280`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993280`
原始查询	`SmilChr07G002200`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
产物	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G03070` (AT3G03070) NADH-ubiquinone oxidoreductase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821133] identity=60.9; qcov=1.01; evalue=3.75e-45; confidence=medium
Rice	`Os08g0161700` (P0577B11.122) - identity=60.8; qcov=0.89; evalue=1.42e-39; confidence=medium
GO	GO:0005747 (GO:0005747); GO:0006120 (mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10276 (zf-CHCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993280

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057774094.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057774094.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057774094.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774094.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774094.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20235639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr7:20235679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C63,C79,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774094.1

109 aa

109

zf-CHCC

PF10276 zf-CHCC 67-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774094.1`	Pfam	`PF10276`	zf-CHCC	Domain	67	103	4.9e-15	56.0	Zinc-finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918111.1
TTTCTTTTTGATTAAAAAAAAAAAAGTTGCATATGCCTCGAGAGAAATATAGAGGATAGGAATGAAGCAACATAAGAAATTTTAGGTGGCAAACGAAATTACTGATACTCCACTTTATATTCCGCACAACTCTTTCATGTGCCCTTTATCTCTCTTGTACTAAATCGAGCGCTCTCTCTACACCTCAGCCCCCGACAATGGCGGCATTCAGGGGAAAGAATGGACTAACAATGGCGACGCACCTCATGAAAACCCTAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993280
ATGGCGGCATTCAGGGGAAAGAATGGACTAACAATGGCGACGCACCTCATGAAAACCCTAACTGGATCTTCGAGAAGCCTCAGCGGCATCGTTAGCAGCGAAGTTGCCACCTCTCATACCCAAAAATGGATGCAGGATTCGAGTAAAAAGTCTCCAATGGAGTTGATCAATGAAGTTCCACCAATCAGAGTAGGAGACAGGATTGCTGTTTGTGAAGGAGATAGTGACCCGGCACTTGGTCATCCAGTTGAGTTCATATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774094.1
MAAFRGKNGLTMATHLMKTLTGSSRSLSGIVSSEVATSHTQKWMQDSSKKSPMELINEVPPIRVGDRIAVCEGDSDPALGHPVEFICLDKDEPAVCKYCGLRYVQDHHH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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