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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002205`

染色体: Chr07 坐标: 20300003-20302820 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002205`
名称	SmilChr07G002205
描述	uncharacterized SmilChr07G002205
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20300003 - 20302820 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993286`
GeneID	`130993286`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993286`
原始查询	`SmilChr07G002205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lisH domain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821080]; symbol=AT3G03130; hit=AT3G03130; species=arabidopsis; confidence=low
产物	lisH domain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821080]; symbol=AT3G03130; hit=AT3G03130; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G03130` (AT3G03130) lisH domain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821080] identity=37.6; qcov=0.389; evalue=1.27e-20; confidence=low
Rice	`Os04g0597900` - identity=70.2; qcov=0.093; evalue=1.64e-16; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993286

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774103.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057774103.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057774103.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774103.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774103.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20300270`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A10,B137,B28,B53,B76,B81,C35,C78,C87
`Chr7:20300363`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	110	A13,A2,A25,A3,A4,A5,A8,B1,B10,B109,B11,B112,B114,B122,B123,B125,B126,B128,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B29,B3,B30,B31,B32,B36,B37,B40,B42,B46,B47,B50,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B62,B63,B72,B75,B80,B85,B86,B87,B9,B90,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C10,C13,C21,C22,C23,C25,C28,C29,C3,C32,C33,C36,C38,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C55,C58,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C74,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,D1,D2,D7,D9
`Chr7:20300367`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	110	A13,A2,A25,A3,A4,A5,A8,B1,B10,B109,B11,B112,B114,B122,B123,B125,B126,B128,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B29,B3,B30,B31,B32,B36,B37,B40,B42,B46,B47,B50,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B62,B63,B72,B75,B80,B85,B86,B87,B9,B90,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C10,C13,C21,C22,C23,C25,C28,C29,C3,C32,C33,C36,C38,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C55,C58,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C74,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,D1,D2,D7,D9
`Chr7:20300480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:20300809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:20300902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:20300912`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A10,A19,A7,B111,B15,B2,B26,B28,B30,B35,B65,B84,C12,C16,C3,C43,C58,C62,D7
`Chr7:20301439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:20301651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr7:20301692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr7:20301733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:20301834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918120.1
CTTTTCCTCATTCATTGCCGCCTTCATTCACACTTCCCACCTGCCGGAATTTCTACTTTGAAGCAATGGATTTCCACAGCCTACCAAGAAGAGAATTGCAGGCCTTCTGCAAGAAGAATAAAATTCCAGCCAACATGACAAATGCCGCCATGGCTGACGCTCTCAAAGCTCTCGAGATCGTTGAAGGAATTGAAGAATTTATGCAGCTTTCTCAATCAGAAAGTGCGCAATCATCAATTGAGCTACCGGATGGCTCGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993286
ATGGATTTCCACAGCCTACCAAGAAGAGAATTGCAGGCCTTCTGCAAGAAGAATAAAATTCCAGCCAACATGACAAATGCCGCCATGGCTGACGCTCTCAAAGCTCTCGAGATCGTTGAAGGAATTGAAGAATTTATGCAGCTTTCTCAATCAGAAAGTGCGCAATCATCAATTGAGCTACCGGATGGCTCGGAGGTAACATCTCCATACGTGCCTCCAACTGGTGGCAGGAGTACACGTCGGAGAAATGTCGTGAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774103.1
MDFHSLPRRELQAFCKKNKIPANMTNAAMADALKALEIVEGIEEFMQLSQSESAQSSIELPDGSEVTSPYVPPTGGRSTRRRNVVKDDVEALTSIMTTTRRTTRRTAAKASNESQVDAMETPAVVAQASRRKVQMASACLKMDSQLKECVEEQKKDSLMTPAAVGVASRRRRAEETEKKMYSTRRSVRLAVKSVQMSNSVKSEGSELSNNELFAKDCEDQEVNQKESLEDRNEISGIPGVDAIENVDENKEESEVVSAEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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