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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002208`

染色体: Chr07 坐标: 20321681-20323632 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002208`
名称	SmilChr07G002208
描述	protein MODIFYING WALL LIGNIN-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20321681 - 20323632 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993289`
GeneID	`130993289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993289`
原始查询	`SmilChr07G002208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MODIFYING WALL LIGNIN-1-like
产物	protein MODIFYING WALL LIGNIN-1-like
Arabidopsis	`AT5G17210` (AT5G17210) transmembrane protein, putative (DUF1218) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831585] identity=58.3; qcov=1.01; evalue=1.22e-83; confidence=high
Rice	`Os06g0114700` - identity=63.3; qcov=0.995; evalue=2.25e-84; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06749 (DUF1218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774106.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774106.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774106.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774106.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774106.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20321894`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B14,C2,C45,C77
`Chr7:20321894`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B14,C2,C45,C77
`Chr7:20321960`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A20,B118,C54,C69,C75
`Chr7:20321960`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A20,B118,C54,C69,C75
`Chr7:20321974`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr7:20321974`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr7:20321988`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A1,A11,A15,B106,B117,B120,B138,B139,B21,B31,B36,B38,B39,B4,B41,B57,B58,B67,B69,B70,B74,B77,C15,C20,C27,C34,C42,C49,C56,C64,C66,C7,C76,D11
`Chr7:20321999`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A23,B128,B130,B14,B15,B27,B50,B52,B57,B83,B98,C2,C28,C45,C55,C61,C65,C77,C81,D11,D6
`Chr7:20322003`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A23,B128,B130,B14,B15,B27,B50,B52,B57,B83,B98,C2,C28,C45,C55,C61,C65,C77,C81,D11,D6
`Chr7:20322090`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B121,B6,C67
`Chr7:20322090`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B121,B6,C67
`Chr7:20322514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774106.1

208 aa

104

208

DUF1218

PF06749 DUF1218 61-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774106.1`	Pfam	`PF06749`	DUF1218	Family	61	155	1.7e-32	112.4	Protein of unknown function (DUF1218)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918123.1
ATGATTCAATTATAGAGTTAATAAAATAAAGCAAAAACCTGTAGCCACTAAAAGGAGAGAGTGAAAAAAATCTTTAATTATTTAAAACTAATAAAATAGGAGTACAGTAGTAGCAATAATAAGTAGTTGCTTGAGTTTCACACTTTGGCGCAAACTGGAAATCTCGTCGGTTCAATGTCTTCGGCTTTTGGTTACCGTGGCAACTGCAAGTGATTAGAGAGAGAAAGCGAAAATGGAGGTGGAGAGAAGAAAGGTGATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993289
ATGGAGGTGGAGAGAAGAAAGGTGATTCTAGTATGCTGCGTCGTCGGATTTCTCGGTCTGCTATCTGCTGCGACAGGCTTTGCTGCGGAAGCTAAGCGGATTAAGGGTGGGCAGGTCCAGTTTCCCTCTCCTGAAGAATGTATATATCCCAGAAGTCCTGCCCTAGGCCTTGGTTTAACGGCGGCTGTTGCTCTCATGATTGCTCAAATTATCATAAATGTTGCAACTCGATGTGTTTGTTGTAGAAAAGGCCCACATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774106.1
MEVERRKVILVCCVVGFLGLLSAATGFAAEAKRIKGGQVQFPSPEECIYPRSPALGLGLTAAVALMIAQIIINVATRCVCCRKGPHQSNSNWTTALICFIISWFTFVIAFLLLLTGAALNDEHGEENLYYTNYYCYVVKPGVFAGAAVLSLASVILGLIYYLTLNSAKNAWGAPVPPPQSHIAMGQPHFPPQDPLFVHEDTYMRRQFT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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